77问答网
所有问题
已知序列的ORF(有内含子)和3'UTR,做实时荧光定量PCR从哪里设计引物可以排除DNA干扰
如题所述
举报该问题
推荐答案 2012-12-06
上下游引物位于内含子两端的外显子上
追问
直接从3‘UTR上设计引物是否可以避免?
追答
不能
温馨提示:答案为网友推荐,仅供参考
当前网址:
http://77.wendadaohang.com/zd/IvWGpvNvN.html
相似回答
...找的基因
序列
只有
orf,
没有非翻译区,怎么
设计引物
啊?
答:
看你的目的了,
如果你是要做表达克隆的话,只有强行从atg开始设计了
,看运气吧,如果primer和oligo分数太低难以进行pcr可以考虑降低碱基的数目,或者按照密码子表更改碱基,但注意不要改变氨基酸。又或者你可以在atg之前插入一些碱基修饰一下你的引物,不过如果你做表达克隆,尤其是融合表达时不能改变你的编...
从新冠核酸检测到
PCR引物
探针
设计3
答:
1. ORFlab基因引物探针的二聚体效应设计时,通常要求控制引物自身的二聚体(自身或配对)形成△G值大于-4.5kc/mol。然而
,ORF
lab基因
引物的3
'端△G值过高,可能导致错配位点形成不稳定双链,影响
PCR
反应。3'端△G值过高,如ORFlab上游引物的-13.4kc/mol,极可能形成稳定的二聚体,显著降低PCR效率。
PCR引物设计
中的问题、保守
序列
在目的基因内、但是引物为什么在保守序 ...
答:
一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了
。需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有分离出这个基因的同源基因,这样我们可以调取这些同源基因,对比查看它们的保守序列设计引物,然后就...
探针
设计
在线-如何实现原位杂交之探针设计
答:
BeaconDesigner7.80Demo
实时荧光定量PCR
分子信标(Molecularbeacon)及TaqMan探针设计软件。 NetPrimerJAVA语言写成的免费
引物设计
软件,用IE打开运行。 TGGE-STARDOS软件,PCR结合梯度凝胶电泳实验引物设计软件。 e-PCR2.3.9电子克隆是一种电脑软件,用来识别DNA序列标签位点(STSs)。 FastPCR6.0.165b2快速设计各种类型
PCR引物,
还...
转基因株系怎样通过
设计
半
定量
RT-
PCR的引物
区分内源表达
与
外源...
答:
因为你是设计半定量RT-
PCR的
引物,所以你并不需要全长
的ORF,
只要一部分序列就可以了。这样你在
设计引物
的时候,将内源基因和外源转入基因进行比对,选取二者特异性的区域设计两对引物。一对是内源基因的特异性引物,一对外源基因的特异性引物。这样你分别用不同的
引物做
RT-PCR就知道是内源或者外源基因...
没有完整
的ORF
是完整的基因么?如何
设计引物
答:
拼接的cDNA序列结果有可能会出现各种各样的情况,没有完整
的ORF
的话建议你去blast一下基因组
序列(
如果你所做的物种的基因组已经测的差不多的话),如果在基因组中能定位到的话就去用基因预测软件预测基因组上的基因并找到外显子,再拼出全长ORF,如果没有基因组信息那就只能去做5'RACE
和3
'RACE了...
PCR
的原理是什么 的原理是什么,它有什么用途
答:
1、核酸的基础研究:基因组克隆 2、不对称PCR制备单链DNA用于DNA测序
3
、反向PCR测定未知DNA区域 4、反转录PCR(RT-PCR)用于检测细胞中基因表达水平、RNA病毒量以及直接克隆特定基因的cDNA 5、
荧光定量PCR
用于对PCR产物实时监控 6、cDNA末端快速扩增技术 7、检测基因的表达 8、医学应用:检测细菌、病毒...
大家正在搜
已知先序序列和中序序列
已知有限序列xn的DFT为Xk
内含子或其互补序列可出现在
内含子是被转录的序列吗
已知序列10,18,4,3
已知序列求DFT
内含子序列
间隔序列是内含子吗
内含子两端序列
相关问题
荧光定量PCR引物为什么要跨内含子设计
可以用基因的utr做定量pcr吗
你好,我想克隆表达ORF,是否一定要从+1开始设计引物,还是...
设计实时定量PCR引物是根据基因的全长设计引物还是根据基因的...
没有完整的ORF是完整的基因么?如何设计引物
一个物种的cds序列可以用来设计荧光定量PCR的引物吗?求高...
RT-pcr或者qRT-PCR引物设计是用ORF来做模板还是...
RT-PCR根据什么序列设计引物