RT-pcr或者qRT-PCR引物设计是用ORF来做模板还是CDs?

我在NCBI中查到一个基因,他的编码序列只是其中一部分

qRT-PCR的引物设计使用CDS,最好扩增的片段能包含一个内含子剪切位点,这样可以通过电泳排除扩增基因组DNA的可能性,让定量PCR更准确追问

那提取出来的总RNA里面为什么有基因组DNA呢?

追答

不一定会有,只是为了排除这种可能性,根据提取RNA的方法不同,或多或少会有些基因组DNA污染的,有的提取方法电泳就能看见DNA的条带,有些方法电泳不可见,但仍然有可能能PCR出来的。所以PCR产物跨内含子基本上是定量PCR引物设计的准则之一了

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