一个物种的cds序列可以用来设计荧光定量PCR的引物吗？求高手指点迷津啊，先谢谢了！！！！

如题所述

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推荐答案 2012-04-04

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其他回答

第1个回答 2012-04-05

如果是用SYBR Green来做。设计的时候要跨外显子的交界区。这样能尽量避免扩增样本中残留的基因组DNA。

转录的时候，外显子和内含子一起被转录，这是序列和基因组DNA一样。剪切后才成为成熟RNA。如果设计引物的时候，至少有一个引物正好跨外显子的交界区。那么只有剪切后的RNA（cDNA）序列才能有效扩增。所以，使用cds序列的时候，先要做一下BLAST，找出交界区，定点设计。

第2个回答 2012-04-04

可以。这就是传说中的qRT-PCR

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