PCR引物设计中的问题、保守序列在目的基因内、但是引物为什么在保守序列设计??

设计引物为什么一定要在保守序列内设计??保守序列在ORF内,在保守序列内设计引物怎么得到能够完整表达的核苷酸序列??得到有功能的蛋白质?

一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了。需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有分离出这个基因的同源基因,这样我们可以调取这些同源基因,对比查看它们的保守序列设计引物,然后就利用这对引物就可以获得这个物种的这个基因的部分序列。然后再设计RACE获得全长序列。另外一种情况则是设计通用引物,很多情况下我们并不需要知道某些基因的全部信息,只要知道他有没有,这种时候就可以根据保守序列设计通用引物。这样的引物可以跨越很多物种获取同一个基因的信息,而不需要根据某特异的物种额外设计多种引物。
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第1个回答  2012-02-22
没有要求必须在什么保守序列内设计啊 如果是要设计过表达的引物 只要保证包含了完整的CDS区就可以啦
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