这个问题可不可以这样理解啊 用保守区作比对 那可变区是用来干什么的 如果比较两个菌株他们的保守区同源性大于95% 他们的可变区会相同吗 O(∩_∩)O谢谢
追答这个我不太熟。我不知道你的最终目的是什么，我个人认为16s的保守区用来设计通用引物，可以p出各个不同的16s来，而可变区是用来作物种区分的，比对的是总序列把。
追问我的最终目的是鉴定土壤中产甲产烷菌的多样性 我看别人用产甲烷菌的特异性引物扩增16sRNA，最后测序并建立系统发育树，我不知道建立系统发育树依据的是保守区还是可变区 ，能不能给一个详细的解释 多谢了 O(∩_∩)O谢谢