设计兼并引物时,只比对十条序列找到保守区,这样的结果可靠吗?

如题所述

前提是看你这十条序列来自哪些物种,这些物种和你要克隆的物种亲缘关系近不近,如果这十条序列都是哺乳类的序列,而你想克隆的是鱼类或两栖类,那么这十条序列比对出来的保守区也不一定就能克隆出你的序列,如果亲缘关系很近,那么克隆出来的机会就很大,如果亲缘关系非常近是不需要十条那么多序列的。比如你有斑马鱼的序列,想克隆其它鲤科鱼类就很容易,但是克隆海水鱼类的基因就很困难。你能说的具体点吗?这样也好具体情况具体分析。追问

我要克隆牛奶子中一个酶的基因,现在只知道这个酶的蛋白序列来源于葫芦科,我现在用这个葫芦科的蛋白序列做blast,找到了100条序列,但是比对后同源性不高,接下来就不知道怎么做了。能帮忙解决一下这个问题吗,谢谢啦!

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