做RT-PCR设计引物时,找引物序列有哪些好方法?

如题所述

第1个回答  2012-06-29
我也做得RT-PCR,是提取某物种中未测序的一段基因。是用近缘物种基因进行比对,得到保守序列设计引物,再提取总RNA,RT-PCR得到目的基因的片段追问

我需要检测的分子,在nucleotide里找不到它的序列,不知道要怎么办,有没有好的建议给呢?

追答

用几种近缘物种的比对呀,找保守区设计简并引物,RT-PCR获得部分片段后测序,根据测得的序列设计特异引物,再用RACE法分别向两端延伸,得到的两段序列拼接就可以得到全序列了

我做的物种的那段基因数据库也没有,就是找近缘物种来设计引物的,目前已经得到结果了。

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第2个回答  2012-06-29
用软件呗,Primer5,Oligo6等专门设计引物的
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