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知道基因序列怎么设计引物
primer6.0
设计引物
-
如何
应用primerprimer6.0设计引物
答:
3.打开Sequence后,会弹出粘贴框,只需要将刚刚复制的基因序列粘贴上即可,然后点击下方的Add
。4.选择上方的红蓝双向箭头的按钮进行引物设计,在设计开始前可以更改设计的参数,包括搜索的碱基范围、引物的长度,碱基数,设计结果显示的引物对数等。5.设置完参数后,点击下方的Search,软件开始分析设计,完成后,点击O...
测序
引物怎么设计
答:
首先,
我们可以在数据库中找到该区域的序列信息,然后根据上述原则设计一对长度为20个碱基、GC含量约为50%的引物
。接着,我们可以利用引物设计软件检查这对引物是否存在内部二级结构或引物间的互补情况。最后,将设计好的引物送到实验室进行PCR扩增和测序验证。如果发现PCR效率不高或者测序结果不理想,我们可...
已知动物PRL
基因序列如何设计引物
已解决
答:
2,
上游引物设计:选取正向5’-3’的基因序列约23bp左右
,copy下来;在这段序列的5’端加上你的上游酶切位点(一般6bp),再在之前加入两个任意碱基作为保护碱基;序列为:保护碱基(2bp)+上游酶切位点(6bp)+基因起始序列5’-3’,引物碱基总长约28-30bp.3,下游引物设计:将序列反相互补,得到...
如何设计
pcr
引物
答:
PCR引物设计方法和原理1、pcr中引物的作用是作为DNA复制开始时DNA聚合酶的结合位点
,在细胞外的条件下,只有通过引物,DNA才可以开始进行复制。2、PCR的技术的主要步骤:DNA变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA。退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合...
知道基因序列
后,
怎样
找到编码蛋白的序列,接着
怎么
进行
引物设计
?求详 ...
答:
1 NCBI--Sequence Analysis--ORF finder--将
序列
贴进去——OrfFinder 2 NCBI -- Primer-BLAST-- 将序列贴进去-- 设定参数 -- get primers 就可以拿到一些
引物
,然后比较筛选;当然还可以到一些软件里去
设计
,如Primer 3等。
如果要使用PCR扩增一段已知的
DNA序列
,要
如何设计引物
答:
把这段
基因
输入
设计
软件里,调节
引物
位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-(5到10度) 延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物。如果你要扩增整个的基因,引物必须要在起始密码子之前,或包含起始密码子。最后加上酶切位点就可以了。
[实用技巧] 构建
基因
过表达载体之
设计引物
详细步骤
答:
对于下游
引物
,我们进一步考虑了保护碱基,确保酶切位点的稳定连接(5.4 图)。最终,我们的引物组合如下:上游引物为CTCGAG CG ATGGAGGAGCCGCAGTCAG,下游引物为ATA GC GGCC GC TCAGTCTGAGTCAGGCCCTTC。至此,我们已经成功
设计
出p53到PCI-neo载体的引物,万事俱备,只待进行PCR酶切连接实验,以实现
基因
...
引物
是人工合成的已知目的
基因
的一小段核苷酸
序列
,人工合成引物时需要...
答:
过长或过短都会降低扩增的特异性。一般我们将
序列
输入到在线平台或者primer、oligo 上
设计
参数之后就可以进行设计了,然后从中选择分值或者网页上靠前的
引物
即可。引物的好坏判断标准:扩增产物的特异性:解释一下熔解曲线峰值单一,扩增曲线呈S型曲线,Ct值在35循环以内,即是一对合格的引物。
...号,可是上genbank blast一下,只有它自己,
怎么设计引物
?
答:
有
基因序列
号,你就可以直接上genebank下载其序列,下载到全序列,你需要扩增的CDS区,也就是编码区,可以全外显子扩增,这样简单一点,也可以做cDNA克隆,然后再做,前者的话就可以直接根据其基因序列NG号
设计引物
,如果是做CDNA的话就根据其mRNA的序列NM号设计引物。
怎样
在NCBI的primerblast里
设计
Q-PCR的
引物
?
答:
方法/步骤 1、首先打开NCBI,选择“Nucleotide”,并在搜索框输入
基因
名。一般用目标基因的突变体1去
设计引物
,也就是要选择目标基因的“transcriptvariant1,mRNA”,没有1就用2、3,以此类推。因为是Q-PCR,所以要去掉内含子,因此用mRNA。2、从上一个页面点击FASTA,可以看到mRNA的
序列
。3、搜索“...
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