RT-PCR的原理是什么?有何用途?

如题所述

原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。

该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。

RT- PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)即逆转录PCR,是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。

首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。

作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组 DNA的污染。

用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT 及基因特异性引物中的一种。对于短的不具有发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可。

扩展资料

反转录酶的选择

1、Money 鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶:有强的聚合酶活性,RNA酶H活性相对较弱。最适作用温度为37℃。

2、禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶:有强的聚合酶活性和RNA酶H活性。最适作用温度为42℃。

3、Thermus thermophilus、Thermus flavus等嗜热微生物的热稳定性反转录酶:在Mn存在下,允许高温反转录RNA,以消除RNA模板的二级结构。

4、MMLV反转录酶的RNase H突变体:商品名为SuperScript 和SuperScriptⅡ。此种酶较其它酶能多将更大部分的RNA转换成cDNA,这一特性允许从含二级结构的、低温反转录很困难的mRNA模板合成较长cDNA。

参考资料:百度百科——RT -PCR



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第1个回答  推荐于2017-09-22
RT-PCR有两种解释:1,最常用的理解:RT 是‘逆转录’(reverse transcription)的缩写2,现在也有人这么用:RT是‘实时’(real time)的缩写1,先说逆转录PCR:这项技术使用的‘逆转录酶’来自逆转录病毒,是一种能按照碱基互补配对原则,以脱氧核糖核苷酸为底物,以寡居dT为引物,把mRNA转换成相应DNA的酶,由于该酶的效果与中心法则(DNA所承载的生物信息表达顺序应该是DNA-RNA-蛋白)顺序相反,故而有'逆转录'之称。由于逆转录反应使用了引物和模板,也是聚合酶链式扩增的(PCR是‘链式扩增反应’polymerase chain reaction 的缩写)故称为RT-PCR。再说其用途:我们提取的RNA主要是rRNA,即核糖体RNA,但很少有人用它做些什么,倒是含量较少的mRNA,即信使RNA是中心法则所述的遗传信息表现的中转站,所以我们要把微量的信使RNA搞出来,更重要的是,RNA太容易分解了,环境中无处不在的RNA酶啊,以及其容易被水解的特点啊,让你不得不尽快把珍贵的信使RNA转化成稳定的形式,于是就有了RT-PCR。2, 再说实时PCR细胞瞬时转录的mRNA种类颇多,各种mRNA含量也有实时的改变,这反映了细胞核内转录因子根据环境要求在做出相应的变化,realtime-PCR,以及quantitative realtime-PCR (简称qRT-PCR)就应运而生。原理:利用PCR高度的特异性,通过特定的引物能在复杂样品中得到的特定序列的DNA,而这种特定DNA的产量跟反应初始阶段模板量是直接相关的。简单说来。经过一个PCR循环,可以把一个模板变成两个,在经过一个循环,就会变成四个,以此类推。如果PCR的检测线是1000个产物,那么当你的初始样品中模板是n个,那就需要经历的循环数为的时候才能检测,这就把循环数与初始样品中模板数联系起来了。也就是说经过计算,达到检测限的循环数就能反映初始RNA样品中某种RNA的含量多少。在实际中,使用了特殊的含有荧光剂的引物,光学检测相应光强度的产物所需的循环数,能高度灵敏的达到目的。realtime-PCR有两种。绝对定量和相对定量。绝对定量常用于逆转录病毒侵染细胞的检测,比如你想知道有多少HIV侵染了样本中的T细胞,你可以收集一定数量的T细胞并提取RNA,通过逆转录,以及taq酶利用HIV的特异引物进行扩增,最终的循环数可以反应你的这群T细胞正在被多少个HIV侵染。相对定量常用于检测实时的转录谱,例如在给药前后,某重要基因转录的实时变化,可以分别收取给药前后的全RNA,用相对转录量不变的基因为内参,如GAPDH或beta-actin,与目标基因转录的转录量对比,来定量反应药物对目的基因转录含量的影响。一气呵成,难免有错,看着玩吧本回答被提问者采纳
第2个回答  2019-12-25
RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT—PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组DNA的污染。BIOG RNA保护剂可有效阻止RNase活性来保护RNA不被降解;保存在RNA保护剂中的RNA样本在-20℃条件可保存六个月,并且加入保护剂的RNA可直接做下游实验,无任何影响。BIOG Super cDNA Synthesis Kit具有超高的灵敏度,最低可检测到1pg总RNA 中的几十个目标RNA分子,反应结果适用于后续的PCR分析、PCR克隆、定量PCR等。
第3个回答  2017-11-17
PCR全称多聚酶链式反应,原理是DNA的体外扩增。
具体来说:在EP管里加入DNA、合成原料(dNTP、引物)、耐热的DNA聚合酶(taq)后,放入PCR仪,PCR仪会利用升温使DNA变性,在聚合酶的作用下使单链复制成双链,进而达到基因复制的目的。
用途:
1、核酸的基础研究:基因组克隆
2、不对称PCR制备单链DNA用于DNA测序
3、反向PCR测定未知DNA区域
4、反转录PCR(RT-PCR)用于检测细胞中基因表达水平、RNA病毒量以及直接克隆特定基因的cDNA
5、荧光定量PCR用于对PCR产物实时监控
6、cDNA末端快速扩增技术
7、检测基因的表达
8、医学应用:检测细菌、病毒类疾病;诊断遗传疾病;诊断肿瘤;应用于法医物证学
第4个回答  2019-01-29
RT-PCR较逆转录pcr,有叫反转录pcr,是聚合酶链式反应的一种广泛应用的变形,在RT-PCR中,一条rna链被逆转录成为互补dna,在一次为模板通过pcr进行dna扩增。使用过BIODAI相关的实时荧光定量pcr监测,CT 值的起跳点还是挺早的。在临床上给药监测啥的,都是有很好的用处的。
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