南京大学全日制本科生的学籍管理中，对于休学与复学有明确的规定。
根据第四十五条规定，学生如果因病需停课治疗超过一学年上课时间的三分之一，或者因其他原因缺课超过上课时间三分之一，或者学校认为有特殊原因需要休学，将被批准休学。休学时间通常为一学年，特殊情况可至两学年，但累计不得超过这个期限。
在休学期间，学生的户口将不迁出学校。因病休学的学生需回家疗养，医疗费用按《南京大学学生卫生医疗规则》执行，往返路费自理。休学学生期满后需在学期开学前向院系申请复学，需提供相关证明材料，如健康证明和校医院复查结果，且可能需要经过政治复查，违法乱纪行为者将被取消复学资格。
学生也可以选择停学创业，但须提出申请和方案，经院长或系主任审核及学校批准后实施。停学创业期间的费用、纠纷等由学生自行承担。若选择自费出国就读，可以办理退学或保留学籍，但保留学籍仅限一年，且有明确的时间限制。
保留学籍期间，学生可以办理旁听手续，但需支付旁听费，成绩将记入学籍档案。未办理手续擅自听课的成绩将不被承认。休学和复学的申请需由院系负责人审批后交由教务处审核批准。
《南京大学全日制本科生学籍管理细则》为了维护正常教学秩序，促进学生德、智、体、美全面发展，依据教育部2005年2月4日颁发的《普通高等学校学生管理规定》，结合本校实际情况，修定本学籍管理细则。本细则指分入学、报到与注册；课程、学分与免修；课程考试与成绩记载；转专业与转学；休学、复学与保留学籍；退学、试读；纪律与考勤；奖励与处分；毕业、结业、肄业；学士学位；出国学习；附则等项的规定。