云南民族大学的化学与生物技术学院有着悠久的历史，其起源可以追溯到1987年恢复高考后成立的理科系，最初名为数理系，内部设有数学、物理和化学教研室。这一年，学院迎来了第一届理科本科学生，数学专业于1978级，而物理专业则在1981年开始招生。
1983年，数理系进一步发展，分为数学系和物理系（理化系），化学教研室随之并入物理系，同时开始为云南省农垦系统培养大专程度的中学数理化师资，并在1985年1月开始输送第一批毕业生。同年，学院决定在化学教研室基础上成立化学系筹备组，加快了化学系的组建进程。8月，化学系正式成立，不仅开始招收化学专业本科学生，还继续为农垦系统培训化学大专学历师资。
1991年，化学系开始招收应用化学方向的两年制大专班，而到了1995年，经省教委批准，又增设了应用化学专科（三年制）招生。1999年，应用化学专科升格为本科专业，同年8月，化学系开始接纳应用化学本科新生。2000年，化学系获得了“有机化学”硕士学位授予权，成为云南民族学院理科系部中唯一具备硕士研究生培养资格的学科。
2001年，学院迎来了首批“有机化学”研究生，而2007年，分析化学专业硕士研究生也开始招生。随着学科的深化和拓展，2002年，学院正式更名为化学与生物技术学院，标志着其在化学与生物技术领域迈入新的发展阶段。
云南民族大学化学与生物技术学院创建于1986年，是云南民族大学具有硕士、学士授予权的理工学院。现位于学校莲华校区，设有化学、应用化学、生物技术、环境科学4个本科专业和有机化学、分析化学两个硕士学位授予点以及应用化学研究所和民族药研究所。