先天性冠状动脉瘘的自然闭合率极低，并发症如细菌性心内膜炎可能发生。Libe 冠状动脉心腔瘘rthson等研究了173例患者，平均年龄24岁，6%的患者因冠状动脉瘘死亡，其中20岁以下的病死率是1%，而20岁以上成年人的病死率则高达14%。手术治疗冠状动脉瘘效果良好，手术死亡率低于2%，术后心肌梗死的发生率约为3%，残余漏或复发率约为4%。中国医学科学院阜外医院的32例手术治疗中，无手术死亡，无术后心肌梗死，仅1例术后残留漏，通过两次手术得以治愈。25例患者的随访平均持续4.5年，手术成功率高达96%，并且没有晚期死亡的病例。
预防措施方面，应针对可能的致病因素采取行动，提倡优生优育，妊娠早期避免病毒感染，减少子宫受不良物理和化学因素的影响。必要时，进行产前遗传学或染色体检查，以预防问题的发生。治疗策略取决于病情，流量小且无症状的患者，可能无需手术，但需注意预防感染性心内膜炎；有症状的患者应尽早手术，如结扎或修补瘘口，亦可通过导管将永久性栓堵药物注入阻塞瘘口，术后症状通常会改善。对于不宜手术的患者，可采用药物对症治疗。
冠状动脉瘘指左右冠状动脉与心脏或大血管存在先天性异常交通。多为先天畸形。半数以上患者可无症状，仅在体检时发现心脏杂音，但左向右分流量较大者，可在体力活动后出现心悸、心绞痛及心力衰竭症状。如瘘管进入右房者，更易出现心衰症状。瘘入冠状静脉窦者则易发生房颤