申徽字世仪，魏郡人。性情慎重，不乱与人交往。元颢进入洛阳，任用元邃做东徐州刺史，元邃延请申徽做主簿。元颢失败，元邃被装入囚车押送到洛阳，元邃原先的官吏宾客都抛弃他而离开，只有申徽去送别他。等到元邃得到赦免，就广召宾客朋友聚会，赞叹申徽有古人风骨。不久就任命他做太尉府行参军。
孝武初年，文帝和他交谈，认为他是个奇才。文帝观察申徽深沉细密有度量，每逢有事都很信任地委托他去办，于是做了大行台郎中。当时军队和国家刚刚建立，幕府的事务很多，四方文书檄文都是申徽写的。河桥之战，朝廷的大军出师不利，近侍官吏逃散得很多，只有申徽不离左右，魏帝称赞他。（大统）十年，升任给事黄门侍郎。
朝廷屡次征召刘彦进京朝见，他不接受命令，又在南方勾结吐谷浑，将要图谋叛乱。文帝对动用大军镇压感到为难，想用灵活的谋略擒拿他，于是让申徽做河西大使，秘密命令申徽谋取刘彦。申徽轻车简从，率五十人骑马出发，到了以后，住在宾馆。刘彦见申徽单独一人来做河西大使，就不怀疑他。申徽就派一个人暗暗地劝刘彦入朝，用来揣测刘彦的意图，刘彦不听从。申徽又派人赞助促成刘彦驻守本地拒绝进京的计策，刘彦就听从了他，于是来到宾馆。申徽先前已和瓜州的豪门大户秘密商议捉拿刘彦，于是就呵叱捆绑了刘彦。刘彦说自己没有罪，申徽一一列举他的罪状说：“你没有一点点的功劳，却掌管着一方重要的权力，依仗着地方偏远做一些违背欺骗朝廷的事，不恭敬地履行自己的职责，却怠慢侮辱朝廷使者，轻视朝廷的命令。计量你的罪行，实在是杀了你也抵不了你的罪行。但在我接受朝廷的命令那天，本是要我把你送到朝廷，遗憾的是我不能立即申明法度将你惩处，来向边地的百姓谢罪。”于是宣读诏书慰问官吏、老百姓和刘彦的下属，又说大军接着就到，城内没有一个人敢闹事。
十二年，因为申徽讲信用，与边地的老百姓关系融洽，被任命为瓜州刺史。申徽在瓜州五年，以身作则，勤俭节约，边地的老百姓生活快乐而安定。申徽性情勤奋细密，在做官期间，文书案卷不论大小都要亲自查看，因此事情没有拖延的，官吏不能做邪恶狡诈的事。后来虽然担任公卿的职位，但这志趣一点不松懈。后来他离京做襄州刺史。当时南方刚刚归附，按旧日风俗官员都相互交往馈赠钱财，申徽性情廉洁谨慎，于是就画了（廉吏）杨震的像放在寝室来自我告诫。等到被替代回京，老百姓和官吏送他的人延续几十里。申徽自以为对百姓没有什么恩德，内心感慨感到惭愧，于是写了一首诗，题在清水亭上。不管老人少年，听说这事，都争着前来阅读，互相称赞说：“这是申使君手迹。”人们纷纷抄写吟诵这首诗。
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