保证实验动物的微生物学、寄生虫学质量的具体措施如下：
实验动物的微生物和寄生虫控制的水平，是其质量高低及标准化程度的重要标志。要保证实验动物的微生物和寄生虫控制的质量，必须对动物进行有一定程序的、定期的检测。
除了由实验动物单位，自行的监控之外，还应由具有第三方公证地位的质量监督机构，以国家有关部门颁布的标准为准绳，采用国际公认的技术、方法，予以定期的监测和确认。
1、微生物监测：
根据动物微生物和寄生虫控制等级的标准要求，采用病理学技术，微生物的分离、培养、鉴定技术，免疫血清学技术等。对目标微生物的检测，不能只采用某个单一方法，应选用上述各种技术中，敏感性和精确度高、成熟和公认的方法，从病理、微生物、免疫血清学等方面综合评判。
2、寄生虫监测：
包括体外和体内寄生虫的检测，普通级动物主要检查体外寄生虫，!更高等级，则按该等级标准要求进行体外和体内寄生虫种类的检定。采用皮肤和被毛检查、病理解剖、肠道寄生虫和血液原虫的显微镜检查等，以发现虫体、虫卵和主要特征性病理变化为判别依据。
实验意义：
实验动物携带的微生物及寄生虫有严格的控制，尤其是可引起实验动物爆发烈性传染性疾病的病原微生物，及引发严重侵袭病的寄生虫。即使是一般性的病原微生物和寄生虫的携带，都必须严格控制。
目的是保证实验动物的品质，防止出现:动物及实验的损失，一些疾病，如鼠痘、犬细小病毒出血性肠炎、兔球虫病等会导致动物大批量的死亡，动物群体的健康素质下降，正在进行的科学实验被迫中止，造成难以计算的经济损失。
威胁人类健康，实验动物的疾病，有许多是人兽共患的传染性疾病，有很多情况是动物仅呈隐性感染，或仅成为病原携带者，对饲养和动物实验人员潜伏着巨大的危害，并可能造成烈性传染病大规模的扩散。
影响实验结果，实验动物的微生物和寄生虫感染会不同程度地影响动物实验的结果，从而影响实验数据的准确性和可靠性，甚至会推导出错误的结论。