一般是按合同约定进行的。以下实际的合同约定，可作楼主为参考：
工程预付款
发包人向承包人预付工程款的时间和金额或占合同价款总额的比例：合同签定后十日人，预付合同总价的7%
扣回工程款的时间、比例：第二、三、四次付工程进度款的同时。
工程量确认
承包人向工程师提交已完工程量报告的时间：每次支付工程进度款前10天。
16、工程款（进度款）支付
双方约定的工程款（进度款）支付的方式和时间：
承包人按国家现行规范、标准及相关规定（包括质量和安全）施工，施工期间按照形象进度节点支付工程款，即按投标报价分：
地下室和裙楼按照每完成一层相应的工作量支付一次，塔楼按每完成三层相应面积支付一次，每次支付额度为节点完成工程量的75%；
主体封顶后剩余工程量按月进度暂按投标报价折算，按75%支付工程进度款。
各阶段付款时间应在该节点完成后10天内。下次对上次付账按实进行调整付款。
工程完工后，合同范围及完成项目于竣工验收前支付到合同总价款的75%；竣工验收合格后14日内支付至合同总价款的80%；工程交付并将承包人承包范围内及专业工程完整的工程竣工验收资料交给发包人接收、工程竣工决算审计完成后（自竣工结算报告和竣工全套决算资料报送发包方后六个月内完成审计和财务结算工作。有异议部分款项在六个月内未达成一致，该部分款暂不支付，待双方达成一致时付款），除留5%的工程保修金外，余款在28天内付清。各阶段付款基数均不含甲供材料款及专业分包款项。
参考资料：实际合同参考