关于十二支彼此间有什么关系，异说纷纭。在原始经典中，并没有作具体的叙述。但到了部派佛教，就将十二支说成三世两重因果。十二支中，最初的无明、行二支是过去世的二因，其次的识、名色、六处、触、受五支是现在世的五果，并以这些来说过去与现在的一重因果；接着的爱、取、有三支是现在世的三因，最后的生、老死二支是未来世的二果，并以这些来说现在与未来的一重因果。综言之，即是所谓的三世两重因果，列表如下︰
传统三世两重因果十二支的说法︰(1)无明是指过去的无明诸烦恼。(2)行是过去所造的善恶诸业。(3)识是在母胎内最初一刹那的五蕴。(4)名色是胎内五位（羯刺蓝─第一周、额部昙─第二周、闭户─第三周、健南─第四周、钵罗奢法─第五周以后至出生）中的前四位。(5)六处是指在胎内第五位，即在母胎中完成眼等诸根之位。(6)触是出胎后生起单纯的触（认识）的作用。(7)受是五、六岁至十三、四岁间，起单纯苦乐感受作用。(8)爱是十四、五岁以后，贪着财产、爱欲之位。(9)取是增长前支贪着之位。(10)有是爱欲、取相之善恶业，成为习惯力而引起未来果报。(11)生是生出未来果报之位。(12)老死是未来受生后，与名色、六处、触、受一起发生之位。
┌无明─惑（缘）─┐
├行 ──业（因）─┴ 过去世二因─┐
├识 ─┐---------------------------------- ├ -一重因果─┐
├名色│---------------------------------- │----------------│
├六处├苦（果）──-现在世五果─┘---------------- │
├ 触 - │----------------------------------------------------├三世两重因果
├受 ─┘ --------------------------------------------------- │
├爱─┐----------------------------------------------------- │
├取─┴惑（缘）─┬现去世三因─┐------------------ │
├有──业（因）─┘---------------- ├---- 一重因果─┘
├生─┬苦（果）──未来世二果─┘
└老死┘
南方佛教与后世大乘佛教，均把十二缘起解释为三世两重因果，这也是一般佛教传统的说法。但是瑜伽行派的法相宗（护法系统），把十二缘起解释为二世一重因果，即从无明至有等十支是现在世，生和老死二支是未来世。
说一切有部的通说，是将十二缘起解释为三世两重因果，但是此一部派对十二缘起的状态，析为四种，而说四种缘起。即(1)刹那缘起、(2)连缚缘起、(3)分位缘起、(4)远续缘起。其中(1)刹那缘起，是表示十二支作用于同一刹那之‘同时的论理关系’。(2)连缚缘起，是说明做为肉体、精神现象的十二缘起，时时刻刻在进展变化，而我们日常经验的身心活动即是依据此种缘起关系产生的。(3)分位缘起，是指将十二支分为过去、现在、未来等的三世两重因果。(4)远续缘起，谓十二支不仅表示三世，而是在说明久远的过去至遥远的未来，长时间的关系。
近代，西洋、日本学者对十二支，有种种议论。或就传统立场而言，或以为同时因果之论理关系才是佛的真说，或就折衷立场而言等。但是，释尊在说法时，曾由于对象智慧、根机及理解力之不同，而对同一教理，或做第一义的解说，或以浅近的例子或譬喻，做极通俗的说法。故对十二缘起的说法，我们也不能做片面的决定。《阿含经》中，虽然没有将十二缘起视为三世两重因果的胎生学解释，但仍可发现它的萌芽。以上所提，四种缘起中的第二连缚缘起，不仅是今日我们最易理解的，也是《阿含经》所论述的。
◎附一︰姚长寿〈十二有支〉
十二有支，也叫十二因缘、十二缘起。原出《阿含》经典，包括无明、行、识、名色、六处（六入）、触、受、爱、取、有、生、老死十二支，称为‘十二有支’。
这种结构，在佛教原始经典中是为探求有情众生生死苦恼的缘起而设立的。无明（对佛教真理不能自觉）为缘引起行（善恶行业），行为缘引起识（识别作用），识为缘引起名色（身心），名色为缘引起六处（眼、耳、鼻、舌、身、意六根），六处为缘引起触（反应），触为缘引起受（感觉），受为缘引起爱（妄执），爱为缘引起取（追求执着），取为缘引起有（存在），有为缘引起生，生为缘引起老死。以此次序构成了‘此有故彼有，此生故彼生，此无故彼无，此灭故彼灭’的相依相对的因果关系，而说为‘十二因缘’。
后来的小乘论书把十二因缘同轮回相配，众生由过去的业而受现世的果报，由现世的业而受未来的果报，就有说众生涉三世轮回的次第缘起。《俱舍论》把十二因缘分成四种︰(1)刹那缘起，于刹那间立十二支；(2)连缚缘起，十二有支因果无间，连续而起；(3)分位缘起，立三世两重的因果关系，从胎生学的角度来解释十二因缘；(4)远续缘起，悬远相续无始，而立十二支。其中分位缘起说为有部所采用。
依分位缘起说，过去世无始的烦恼，叫做无明。依过去世烦恼而作善恶行业，叫做行。无明和行，称为过去二因。由这过去二因，心识开始活动，在受胎的一刹那成为有情的分位，这就是识。受胎开始的第二刹那以后，六根尚未完备的有情分位，叫做名色。在胎内六根具足，即将出胎，叫做六处。出胎以后至二、三岁，只有接触感觉，尚未识别苦乐，叫做触。四、五岁以后到十四、五岁，对事物渐能识别苦乐，是为受。以上从识到受，称为现在五果。十六、七岁以后，爱欲渐盛，叫做爱。三十岁以后，贪欲旺盛，叫做取。依爱取的烦恼，造种种的业，定来世的果，这就叫做有。以上爱、取、有，称为现在三因。依这现在世的三因而于未来出世的分位，叫做生。自生至死，叫做老死。生和老死，称为未来二果。这样，过去世、现在世、未来世的三世，加上两重的因果，合称为三世两重因果。
唯识宗立二世一重因果，《成唯识论》卷八设从无明到有十支为因，生和老死二支为果。此十因二果，必不同世。如从过现二世来看，十因在过去世，则二果为现在世；如从现未二世来看，十因为现在世，二果即在未来世，终究不出二世一重，所以称为二世一重因果。因为无明和行二支是引出识至受五支的因，所以这二支叫做能引支，五支叫做所引支，合这七支为牵引因。爱、取、有三支为因，缘起生和老死二支，所以称爱、取、有三支为能生支，或生起因，称生和老死二支为所生支，或所引生。
天台宗立思议生灭、思议不生不灭、不思议生灭、不思议不生不灭四种十二因缘，与化法四教（藏、通、别、圆）相配，说三因佛性。
