脑血栓形成的急性期，主要是要改善脑血液循环，防止脑水肿。改善脑血液循环，增加脑的血液量，促进侧支循环，常选用一些脑血管扩张剂，如低分子右旋糖苷250毫升，加罂粟碱60毫克，静脉滴注，每日1次，7～10次为1疗程，一般在发病后24小时内使用，或在发病后第4周选用，轻症病人在发病后可立即应用。此方法不可久用，以免成瘾。也可用烟酸100~200毫克，加入5%葡萄糖或生理盐水250～500毫升中，每日静脉滴注1次，7~10次为1疗程，其他的脑血管扩张剂，尚有维脑路通、甲胺乙吡啶（培地院）、西比灵、脑益嗪、抗栓丸等。
经临床排除出血性脑血管疾病，并没有慢性出血倾向的疾病（如活动性消化性溃疡），也没有严重肝肾疾病，而病人为进行性加重的脑血栓形成患者，或者为暂时性脑缺血发作，可以考虑抗凝疗法，但是，应该每日观察出血时间、凝血酶原时间及活动度，常用的抗凝药有肝素、双香豆素及新抗凝。
溶栓疗法，愈是发病早期，效果愈好，常用尿激酶2万～10万单位，加入5%葡萄糖液500毫升中静脉滴注，或在脑血管造影的同时，有针对性地对有关具体血栓实施溶栓治疗，效果更好。近些年来，有人倡导在脑血栓形成的早期应用蛇毒制剂，如清栓酶、去纤酶、消栓酶等制剂，静脉滴注也有明显的疗效。
对有颅内压增高的病人，可以应用利尿剂或甘露醇进行脱水治疗，对伴有心功能不全的病人效果更好，如果条件许可，应用高压氧舱治疗或吸入含5%的二氧化碳的混合氧，每小时吸10～20分钟，均有较好的血管扩张作用。有手术适应证的病人，常在发病3周后，考虑动脉内膜剥离术或颈内外动脉分支吻合术。