倭寇难平的本质，是当时经济方面的问题，都是“钱”闹得。
说到倭寇问题，不能不说到两个人。一个是朱纨，一个是戚继光。朱纨因平定倭寇失败，而成就了“忠君爱国”之名，是民族英雄。戚继光因平定倭寇成功而成为“名将”、也是“民族英雄”。
朱纨的名字有个“纨”字，好象是纨绔子弟的样子，其实一点也不纨绔。朱纨出身贫寒，自幼聪颖过人、刻苦读书，27岁中进士（少有的天才）。踏入仕途的朱纨做过知府，在刑部做过郎官；在四川做过兵备使，平定过少数民族叛乱，然后做广东布政使，可谓一路仕途顺利。如果没有以后的抗倭，朱纨或许会安然度过一生。
嘉靖25年，“擢右副都御史，巡抚南、赣”。嘉靖26年七月“倭寇起，改提督浙、闽海防军务，巡抚浙江。”
嘉靖26年，倭寇对沿海的侵扰，终于激怒了嘉靖皇帝。朱纨就这样被朝廷赋予军事之责，担起了抗倭重任。朱纨"改提督浙、闽海防军务，巡抚浙江”。
当时的情况是，“奸民阑出入，勾倭人及佛郎机诸国入互市。”奸民以走私商为主，不仅勾结倭寇，还有西方的欧洲人。只不过，因倭寇离得近而人数比较多罢了，占据了“倭寇”总数的30/100左右。说到底，抗倭就是打击走私贸易。
明初，实行了海禁，放货弃了很多沿海的岛屿。这些岛屿成为明朝走私商、倭寇、欧洲殖民者建立据点的极佳选择。
有钱有人，很容易就能拉起武装，盘踞一方。“闽人李光头，歙人许栋踞宁波双岛屿为主。”暗中，他们与各世家豪族暗中互通，几乎所有有些势力的家族都参与其中。走私贸易者还用一部分走私得来的利润，打点官员。甚至朝堂上也有他们的人。
他们以日常运输为名造出“双桅”大船，帮助运走各种走私物品进行贸易。由于参与的人太多了，法不责众，寻常官员是不敢管的。
闽、浙军备废弛，以福建漳州、泉州为例，“战船、哨船十存一二；漳、泉巡检司弓兵旧额二千五百余，仅存千人。”如此的军备是没有战斗力的。
走私贸易风险不大，还有巨大的收益，自然从之者众多。不仅大家族，平民百姓也参与其中，被利润吸引来的倭寇也越来越多。
以朱纨的智商，当然知道倭寇的根源在于走私贸易。所以到任后，立即对走私贸易进行严打。
朱纨的政策是“严保甲”、“革渡船”，其实就是查户口、查船。户口一保一甲的去查，各处一共有多少户，每户有几口人。每个人都在哪里？在干什么？哪家造船厂造出来几艘船，船在哪里使用？谁去参加了走私贸易，一查自然请清楚楚。船和人查清楚了，打击走私贸易自然会容易成功。
朱纨手腕强硬，该抓就抓，该扣就扣。违法的船扣起来，违法的人抓去来，走私当然无法进行。可是同时，朱纨的严打同时也让参加走私贸易的老百姓受到影响 ，失去生计（这也是无奈的事）。
那些参与走私贸易的大家族骤然受到打击，利润大减，对朝中相关官员的暗中“供奉”也少了很多，这些官员对朱纨是仇视的。于是，走私产业链的“利益”受损者都对朱纨愤恨不已，欲除之而后快。
朱纨上任后，雷厉风行的加强军备，发兵进攻国内的走私武装和国外的海盗。先是在浙江发起双屿之役，俘虏了许栋倭寇天稽，许栋的同党汪直带残部南逃。明军在此修筑了驻防工事，使得外海来的船只无法进入，断绝了这一带的走私贸易。
朱纨的雷厉风行，让浙闽翻了天。各地大家族宣扬朱纨抓的是良民，根本就没有抓过盗贼，朝堂上的也刮起了反对朱纨的狂风。闽人周亮在吏部发力，让吏部想办法派遣官员去分散朱纨的权力。
朱纨大怒，上奏章反驳了周亮。朝堂上的闽浙系官员集体行动，以各种方式攻击朱纨。
朱纨不为所动，继续在各处全力剿杀走私武装，战果颇丰。连欧洲殖民者在诏安的抢劫，也被击败。朱纨把抓到的贼首“李光头”等96人，一并斩首。
这一下朱纨就捅了马蜂窝了，这96人当中有不少是各家族、团体的重要人物。闽浙走私势力在痛失这96人的同时，决定要和朱纨拼命了。
朝堂上，弹劾朱纨的声音铺天盖地，朱纨残害百姓的名声不绝于朝堂。
御史陈九德弹劾朱纨擅杀之罪，朝廷罢免了朱纨的官职，还派兵科都给事杜汝祯专查此案。
朱纨知道大势难改，擅杀的罪名定下来就是死罪。他痛哭流涕：“吾贫且病，又负气，不任对簿。纵天子不欲死我，闽浙人必杀我。吾死，自决之，不须人也。”然后，服毒而死。
果然不出朱纨所料，不久之后杜汝祯就带着“调查报告”向皇帝回报，定了朱纨擅杀之罪。跟随朱纨讨伐倭寇的柯乔，卢镗二人被判了死刑。
朱纨死了，天下人的心寒了、怕了。
朱纨在嘉靖26年七月上任，嘉靖29年自尽，前后3年都不到。朱纨是皇帝任命的封疆大吏，在3年不到的时间里就被逼自杀。没有人是傻子，都知道朱纨案子背后是谁在起做用。“自纨死，罢巡视大臣不设，中外揺手不敢言海禁事。”朱纨成立的海防力量，也被废除。
但是朱纨虽死，他的精神却没有死。倭寇、西方殖民者勾结内部走私者、匪徒肆意抢劫、屠戮沿海地区的现象，终究是要消除的。胡宗宪、俞大猷等人的抗倭活动，一直在持续。
1550年朱纨死时，倭寇的克星戚继光已经22岁了。1553年，戚继光得到张居正的推荐，有了官职，踏上了了剿灭倭寇的征途。
戚继光这位抗倭名将，对倭寇一路剿杀。后来，训练了有名的“戚家军”。戚继光和俞大猷等人合作，经过长期的苦战，消灭了倭寇祸患。