法律分析：只要是在房屋产权交易系统中能够查到名下有房产，在不卖掉且申请贷款的情况下，会被认定为二套房。房产契税计算方式如下：1、如果是购买首套房：当进行交易的房屋面积小于或等于90平方米时，契税税率为1％；当进行交易的房屋面积大于90平方米时，契税税率在原有的基础上减半，即契税税率为1.5％。2、如果买的是第二套房：当交易的房屋的面积小于或等于90平方米时，契税税率为1％；当所交易房屋的面积大于90平方米时，契税税率为2％；3、如果买的是第三套房或以上套数：不管房屋面积大小是多少，契税税率都为3％，没有减免的情况。
法律依据：《中华人民共和国契税法》
第一条 在中华人民共和国境内转移土地、房屋权属，承受的单位和个人为契税的纳税人，应当依照本法规定缴纳契税。
第二条 本法所称转移土地、房屋权属，是指下列行为：
（一）土地使用权出让；
（二）土地使用权转让，包括出售、赠与、互换；
（三）房屋买卖、赠与、互换。
前款第二项土地使用权转让，不包括土地承包经营权和土地经营权的转移。
以作价投资（入股）、偿还债务、划转、奖励等方式转移土地、房屋权属的，应当依照本法规定征收契税。
第三条 契税税率为百分之三至百分之五。
契税的具体适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的税率幅度内提出，报同级人民代表大会常务委员会决定，并报全国人民代表大会常务委员会和国务院备案。
省、自治区、直辖市可以依照前款规定的程序对不同主体、不同地区、不同类型的住房的权属转移确定差别税率。