两种方式都可以，您可以使用手机APP填报专项附加扣除信息，并选择申报方式。
如果您选择申报方式为“通过扣缴义务人申报”，单位可以使用扣缴端软件，获取您填写的专项附加扣除信息，按月计算应预扣预缴税款后，向税务机关办理全员全额纳税申报。在这种方式下，您可以在预扣预缴期间享受扣除。如果您未能及时报送，也可在以后月份补报，由单位在当年剩余月份发放工资时补扣，不影响您享受专项附加扣除。
如果您选择申报方式为“综合所得年度自行申报”的，纳税人直接向税务机关提交信息，扣缴单位无法获取到纳税人的专项附加扣除信息。在这种方式下，纳税人在年度汇算清缴时才能享受扣除并办理退税。
通过扣缴义务人申报：这种是向单位申报个人信息，每个月税务机关会把专项附加扣除相关信息全量推送至单位，单位可以从代扣缴软件获取员工已经报送的专项附加扣除信息，并从中计算出员工应预扣预缴的税款，再向税务机关办理全员全额纳税申报。
综合所得年度自行申报：这种是直接向税务机关申报，即每个月单位发放工资时正常扣税，然后由纳税人自行在第二年去税务机关办理汇算清缴，并将有关信息提供给税务机关，让税务部门其办理退税。
扩展资料：
注意事项：
对纳税人随意变更申报地点，又不报原主管税务机关备案的行为，现行办法没有规定如何处理。在实践中，选择纳税地点容易被纳税人作为逃避纳税义务的手段，也易导致地区间税收恶性竞争。如果纳税人变更申报地点不报原主管税务机关备案，原主管税务机关也无法按规定将纳税人的信息传递给新的主管税务机关。
由于税务机关内部有征收、管理、稽查等多个环节，纳税人的收入信息在各环节资料的移送过程中随时都有泄密的可能。纳税人的信息资料若被外人知悉并被恶意利用，将会给纳税人以及扣缴义务人造成损失。对此尽管《办法》有规定但缺乏具体的操作规范，纳税人难以进行有效监督。
参考资料来源：百度百科-个税申报
参考资料来源：人民网-个人所得税如何自行申报？
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