一般来说，每个用人单位都有权自主制订年终奖的分配方案。如果没有劳动合同或集体合同的约定，也没有企业规章制度的规定，企业可以根据自己的经营情况决定是否发放年终奖，以及年终奖的发放标准和范围等。但是以员工离职作为扣发年终奖的方式值得进一步商榷。
1、企业明确约定年终奖发放方案
年终奖作为激励员工安心工作和积极为企业创造价值的薪酬机制，往往为众多企业所亲睐。企业作为市场经济体制下的经营主体，对本企业的员工有着自主的管理权，可以依据企业经营发展需要和企业文化环境制定各种奖金薪酬制度。
这一方面使得员工在工作时能有一种积极工作获得薪酬上扬的心理预期，另一方面也使得年终奖的具体规定成为是否为员工发放奖金的依据。年终奖制度可以被认为是劳动者与其所服务企业的约定，年终奖是劳动者辛苦工作一年的合法所得，劳动者有权依据企业的年终奖规定获得相应的年终奖励。这种情形下，企业与员工在离职时对年终奖一般没有太多分歧意见。
2、企业未明确约定年终奖发放方案
企业在既没有合同约定，也没有相关规章制度对年终奖作出规定的情况下，将在年终奖发放日之前其协商解除劳动关系的职工排除在了年终奖发放之列，可能有违背法律法规的嫌疑。
如果将年终奖作为劳动报酬而非福利，那么根据《劳动法》第46条的规定，工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬，年终奖属于劳动报酬，所以也须遵循同工同酬的原则。
司法实践中，对于年终奖的争议，往往首先要看集体合同、双方的劳动合同中有没有合理的约定，如果没有约定，则看用人单位的关于有关年终奖的规章制度，如果都没有，那么会要求企业遵守基本的法律原则。可见，年终奖的发放并不是企业可随意而为的。
扩展资料：
案例：中途离职的员工应否获得年终奖
石某于2011年12月5日入职某公司。双方签订了无固定期限劳动合同，约定“年终或合同期满，乙方（劳动者）通过甲方（公司）绩效考核后，由甲方兑现发放乙方的全部年薪收入。甲方支付给乙方的年薪收入包括月发工资、以货币发放的福利以及绩效奖金等项目。”
石某每个月固定发放工资6万元。2013年年初，发放2012年年终奖50万元。2014年年初，因石某绩效考核为C，公司按照其考核等级发放2013年年终奖22万元。2014年12月，石某以公司未足额向其发放2014年11月、12月工资为由向公司发出解除劳动关系通知，双方解除劳动关系。
石某诉至法院，要求公司向其发放2014年度的年终奖。公司则辩称，员工的年终奖以绩效考核情况为基础，而石某中途离职，并未参加年终考核，因此不能获得年终奖。
经过审理，法院认为：石某系因公司未足额支付劳动报酬而于2014年12月与公司解除劳动关系，虽未参与2014年年终考核，但其未参与年终考核并无过错，公司以石某未参与2014年年终考核为由拒绝向石某发放年终奖的理由不成立，法院不予支持。同时，考虑到年终奖的确与考核相关，故法院从公平角度出发，参照石某2013年年终奖标准酌情认定石某2014年年度年终奖具体数额。
参考资料来源：中国法院网-年中离职的劳动者能否主张原单位支付年终奖?
参考资料来源：中国法院网-中途离职的员工应否获得年终奖
是否合法，要看劳动合同中是否有记录，没有记录的是不需要发放的，具体如下：
《中华人民共和国劳动法》
第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
《工资支付暂行规定》
第四条 工资支付主要包括：工资支付项目、工资支付水平、工资支付形式、工资支付对象、工资支付时间以及特殊情况下的工资支付。
第五条 工资应当以法定货币支付。不得以实物及有价证券替代货币支付。
第六条 用人单位应将工资支付给劳动者本人。劳动者本人因故不能领取工资时，可由其亲属或委托他人代领。
用人单位可委托银行代发工资。
用人单位必须书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者的姓名以及签字，并保存两年以上备查。用人单位在支付工资时应向劳动者提供一份其个人的工资清单。
扩展资料：
用人单位不得克扣员工工资，但以下情况除外：
《工资支付暂行规定》
第十五条 用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；
（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。