1、南京这座城市历史上就是国家部委所属企业、大院大所、军方重量级企业及其研究机构、国家重点院校集聚所在，江苏省委省政府诸多机关和不少省属大型企业集团总部驻地。在改革开放之前，是“条块分割”的计划经济体制根深蒂固的堡垒之一。长期以来，南京的发展受多方力量牵制、多种因素影响，“大院经济”、“围墙意识”成为制约南京发展的“慢变量”。
2、南京集聚的高校和科研机构数量在全国位居前三，但是却没能像深圳那样，建立起把科教资源和大企业的人才技术优势转变为经济优势的转换机制。
在苏南发展的第一次战略机遇期，这种转换机制的失灵使得南京丰富的科教资源未能和郊县及其乡镇企业发展很好地结合，南京就失去改变其县域经济薄弱软肋的时机，这一耽误，代价是很大的。
当苏南迎来发展外向型经济的第二次战略机遇期时，由于南京国有经济的比重较高，以及与军工企业的高度配套所带来的封闭性，这座城市的优势科教资源又未能和招商引资、民营经济相结合，失去了又一次的机遇。
3、南京人文因素，由于南京浓厚的历史底蕴，导致南京人安逸并安于现状的性格，远没有浙江人的拼劲和进取，因为长久以来南京人并没有出现过普遍严重的生活困苦情况，人人都能丰衣足食，比上不足比下有余，所以人们并不需要去闯去拼。
4、至于为什么没苏州经济发展的快，我也有自己的想法，现在市场经济社会，能够大量的引进外资绝对是对一个城市的发展起了至关重要的作用，可大家放眼看看苏州以及边县城市，大多数都是日本企业，可是日本企业在南京为什么那么少呢，相信有点历史常识的人都知道，由于战争的原因导致的南京人仇日的情绪，日本企业这么也不可能在南京大量的落地根生，曾经就有过日企在南京被砸的事件..
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