开好的发票，认证勾选系统里查询不到这张发票，可能有以下原因：
1.开票方离线开票未上传，请联系开票方确认开票软件中对应发票的上传状态。
2.确认本企业是否做了税号变更，请登录勾选平台查看“档案信息维护”核实。
3.发票可能为异常发票，请前往“发票查询”模块进行核实查询。
4.请核实发票号码、代码、购方识别号等信息的准确性，确认发票是否开错。
《国家税务总局关于红字增值税发票开具有关问题的公告》（国税总局公告2016年第47号）第一条规定：
1.增值税一般纳税人开具增值税专用发票（以下简称“专用发票”）后，发生销货退回、开票有误、应税服务中止等情形但不符合发票作废条件，或者因销货部分退回及发生销售折让，需要开具红字专用发票的。
2.过180天未认证的专用发票能否红冲，需要分情况来看。
3.如果满足条件“发生销货退回、开票有误、应税服务中止等情形但不符合发票作废条件，或者因销货部分退回及发生销售折让，需要开具红字专用发票的”，随时可以冲红，不管是否超180天是否认证.
4.如果仅仅由于“超过180天未认证没有抵扣进项税额”，不允许冲红。
检查一下你的开票系统是否联网，开具的发票是否已上传到税务局
勾选认证后发票对方作废了，不要抵扣即可，再把当期的账目做个详细的标记，以后日后税务机会查账。
认证平台查询的是增值税专用发票，你收到的是增值税专用发票？
原因可能是发票选择月份/选择号码不对。
附注：
如果是查询清单，进入发票查询，选择月份，然后选择号码，点击上面的清单按钮就会弹出清单的窗口，点击就可以看到。
如果是发票明细/汇总表查询，进入开票系统后点击报税处理，再点击发票资料，选择月份、发票种类相关信息，就可以看到了。
不能，查询平台的目的就是取消原认证系统。
个别企业在增值税发票勾选平台进行发票勾选时查不到相关发票，可能有以下原因：
（1）开票方离线开票未上传，请联系开票方确认开票软件中对应发票的上传状态；
（2）确认本企业是否做了税 号变更，请登录勾选平台查看“档案信息维护”核实；
（3）发票可能为异常发票，请前往“发票查询”模块进行核实查询；
（4）请核实发票号码、代码、购方识别号等信息的准确性，确认发票是否开错。
请参考
在增值税发票勾选平台勾选认证发票，查不到发票信息，可能的情况是：开具发票信息上传有一天的时间差；对方离线开具发票，发票信息未上传；发票可能为异常发票。等等
那可能是对方才开出来得发票，在开票系统里面还没有上传成功，所以你这边暂时查询不到，可以过一段时间再来查询，还有就是确定开票资料确认无误，也可能是开票错误造成的。