1、第3集 终于捉到宠物小精灵了（小智的绿毛虫进化铁甲蛹）
剧情简介：白天更加漆黑的常磐森林，充满了许许多多的昆虫神奇宝贝，小智收服的第一只神奇宝贝─绿毛虫，却喜欢着害怕毛虫的小霞，产生了一些趣事。在收服了第二只神奇宝贝─比比鸟之后，火箭队为了夺取皮卡丘的行动，而比比鸟又在阿柏蛇及瓦斯弹的双重攻击下受伤，绿毛虫却以反败为胜的姿态更进化成铁甲蛹。
2、第42集 椰蛋树军团大前进（小智的小火龙进化成火恐龙）
剧情简介：小智一行人来到了一个嘉年华节，他们打算好好玩一玩。正当小智和小刚在跳舞时，小霞发现了魔术师马健，一个刚刚被助手抛弃的魔术师。被再三请求后，小霞当了马健的助手，可是他的魔术过于糟糕以致被老板开除。为了使马健重拾信心，小智等人想尽办法帮助他…
3、第45集 复活？化石小精灵（小智的火恐龙进化成喷火龙）
剧情简介：小智一行人来到了大傻谷，与宿敌小茂相遇，原来小茂和其他人都是为了发掘大傻谷的宝可梦化石而来。因为火箭队的捣乱，小智落入大傻谷地底下，并在那遇见菊石兽、化石盔等远古宝可梦…
4、第76集 小精灵联盟开幕 水之场地（小智的大钳蟹进化巨钳蟹）
剧情简介：小智一行人来到了某个村落路口，发现了小次郎的寻人启事并被带到了小次郎的家。但真相却是小次郎的父母设计将小次郎骗回家并要求与鲁美嘉结婚。不过小次郎的卡蒂狗将小次郎救出，小次郎道出离家出走的真相。他打败鲁美嘉后，小次郎重归火箭队后离去。
5、第82集 真新镇，新的出发（小智的比比鸟进化比雕）
剧情简介：小智靠著被激怒的喷火龙救下了皮卡丘。事后，大木博士拜托小智一行人前往橘子诸岛的岱柑岛取回内木博士的特殊精灵球，小智欣然应允。刚出真新镇，小智遇上了一群烈雀和波波族群争夺地盘，为了救出被大嘴雀围困的波波们，小智派出自己的比比鸟，带领野生的波波和比比鸟抗争。过程中，比比鸟进化为大比鸟。为了保护波波们，小智将大比鸟留下来保护波波们。
3.终于捉到宠物小精灵了（收服绿毛虫→铁甲蛹， 收服比比鸟
10. 猜不到有意外收获（小智收服妙蛙种子
11. 失去主人的小火龙（小智收服小火龙）
12. 杰尼龟军团登场（小智收服杰尼龟）
13. 正辉的灯塔 （小智收服大钳蟹）
23. 在小精灵塔收服幽灵（收服鬼斯通
25. 火爆猴，别生气哦!（小智收服火暴猴）
29. 格斗小精灵大决斗（火暴猴离队
35. 迷你龙的传说（收服肯泰罗）
42. 椰蛋树军团大前进（小智的小火龙进化成火恐龙）
45. 复活？化石小精灵（小智的火恐龙进化成喷火龙
76. 小精灵联盟开幕－水之场地（小智的大钳蟹→巨钳蟹
82. 真新镇，新的出发（比比鸟→比雕，比雕离队）
85. 拯救乘龙（收服乘龙，小建加入
95. 大胃王卡比兽，大恐慌（收服卡比兽
114. 再见了 乘龙 （乘龙离队）
120. 赫拉克罗斯对抗大甲（收服赫拉克罗斯
127. 好胜的菊草叶 （收服菊草叶
135. 再见了喷火龙，直到下一次重逢~！（在喷火龙山谷喷火龙离队）
148. 杰尼龟队燃烧斗志！像火一样. （杰尼龟离队）
152. 小锯鳄是谁的？小智对抗小霞. （收服小锯鳄，小霞的蚊香蝌蚪进化成蚊香蛙）
155. 抓到漂亮的猫头夜鹰（收服猫头夜鹰）
162. 捕虫大会 在自然公园收服他！（收服大针蜂，大针蜂送奈奈）
200. 再见了菊草叶，电气的迷宫（菊草叶→月桂叶）
226. 再见妙蛙种子！大木家后院大冒险！ （妙蛙种子离队）
231. 蛋要孵化了 （得到小小象）
253. 烟墨道馆的龙之牙 (喷火龙归队）
258. 乘龙之歌 （与乘龙重逢）
259. 保护神秘蛋，在暴风天中诞生新生命（由基拉加入队伍）
265. 班吉拉与由基拉 （由基拉离队 )
超世代
AG04.傲骨燕多多！危险多多！在橙华森林收服它！ （小智收服傲骨燕，小刚归队）
AG07.木守宫之森！保护巨大树！ （小智收服木守宫
AG23.海边的捣蛋鬼--龙虾小兵登场！！ （小智收服龙虾小兵）
AG58.闯越钢之谷！煤炭龟VS大钢蛇 （小智收服煤炭龟
AG66.一触即发！爆音怪VS森林蜥蜴 （小智木守宫进化成森林蜥蜴）
AG80.首度挑战！空中竞技?宠物小精灵套环者！！（小智傲骨燕进化成大王燕）
AG108.收服雪童子吧！ （小智收服雪童子
AG123.开幕！豪华庆典(3) （小智的雪童子进化成冰鬼护）
AG154.震撼！吃惊！电击怪 (小智的小小象进化成顿甲）
AG178.惊异！巨大请假王之山 (小智与长尾猴相遇)
AG181.小遥VS小瞬！最后的战斗！（小智收服长尾猴）
珍珠钻石
第2集：寻找皮卡丘！202号道路！ ！（小智收服胖胖翁，小次郎得到捕虫草）
第5集：收服嫩苗龟（小智收服嫩苗龟）
第13集：胖胖翁加油! (小智的胖胖翁进化成卷毛翁)
第52集：双人合作赛！决胜战！！（小智收服小焰猴）
第55集：长尾猴与叉尾浮鼬！各自的道路！！（小光的叉尾浮鼬和小智的长尾怪手交换）
第64集：滑翔天蝎与天蝎（小智收服天蝎）
第85集：天蝎！友情之翼!!(小智的天蝎进化成滑翔钳蝎)
第100集：嫩苗龟、树林龟…然后土台龟！（小智的嫩苗龟进化为树林龟）
第118集：神奇宝贝圆环！天空大决战!(小智的椋鸟进化成姆克鹰）
第132集：全员对战！真嗣对抗小智!（后篇）（小智的小火猴进化成猛火猴）本回答被提问者采纳
在《忍者村决战！呱头蛙对劈斩司令!!》中，呱头蛙进化为甲贺忍蛙并战胜了兵太夫的劈斩司令，在一瞬间变身为外貌与小智相似的型态。
然而这并不是超进化。
里面目录每集标题后面括号都会写明,自己搜一下吧,