农村的自建房如果想加盖2层的话，必须手续齐全。只要由审批手续，就不违法。各地对这方面的规定都不一样，有些地方要求拿到相关部门的审批文书、而有些地方只需要村委签字同意，有些地方则只需是自己名下的
宅基地可。
农民建房申请宅基地的审批程序：
1、农村村民建住宅，首先向
集体经济组织提出申请或城管部门提出申请；
2、村集体经济组织对申请建房户在醒目的地方进行张榜公示(15个工作日以上)；
3、国土资源管理所及镇社会事务办公室到实地对申请人是否符合条件，拟用地是否符合规划等进行初审；
4、公布期满无异议后，将符合“一户一基”条件的用地户按规定报乡镇人民政府审核后，报县人民政府审批(占用
农用地的按规定报市政府办理农用地转用审批手续)。
5、宅基地批准后，国土资源所及镇社会事务办公室到实地批放宅基地，并发放
选址意见书，规划许可证，
施工许可证(“一书两证”)。
6、村民住宅建成后，国土资源所到实地检查是否按批准面积和要求使用土地，对符合要求的建房户核发集体
土地使用证书。
7、村民凭土地使用证及规划许可证申请办理
房屋所有权证。