增值税专用发票先认证、再申报抵扣，这样操作了才叫抵扣。增值税一般纳税人，按销售计算销售税额，按进项计算进项税额，差额才需要交税。
步骤如下：
1.打开电子税务局，选择发票抵扣勾选。
2.勾选本次抵扣的发票记录，点击提交。
3.点击确定。
4.选择抵扣勾选统计。
5.点击申请统计。
6.系统自动生成抵扣发票统计表。
7.点击确认，增值税专用发票抵扣完成。
增值税发票如何进行抵扣?
先认证、再申报抵扣，这样操作了才叫抵扣。增值税一般纳税人，按销售计算销售税额，按进项计算进项税额，差额才需要交税。
销项税额很好计算，你的含税销售额，包含不含税销售额和税额，不管是你否开具增值税专用发票，都需要计算的。一.进项税额有一些限制，主要是三点：
1、是一般纳税人(小规模纳税人不允许抵扣，也就不存在进项税额);
2、采购进项对应的货物或劳务，是用于应税项目的;
3、取得抵扣凭证(即增值税专用发票或其他允许抵扣发票的抵扣联，没有抵扣联是不能抵扣的)。
当取得抵扣凭证并符合抵扣条件时，需要先认证，所谓认证，就是将进项发票与税局服务器比对，相符时就认证通过(允许抵扣)，然后在次月申报时，需要在增值税纳税申报表上申报你一个期间认证通过的进项税额，并从销项税额中抵减，抵减后的差额做为当期应纳增值税额进行申报。
增值税是以商品生产流通环节或提供劳务的增值额为计税依据而征收的一种税。一般纳税人销售或进口货物税率有17%和13%，提供加工、修理修配劳务税率17%
增值税应纳税额=当期销项税额-当期进项税额
销项税额是指纳税人销售货物或应税劳务,按照销售额和增值税税率计算并向购买方收取的增值税额.
进项税额是指纳税人购进货物或接受应税劳务,所支付或负担的增值税额.
二.准予从销项税额中抵扣的进项税有：
1.从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
2.从海关取得的完税证上注明的增值税额。
3.购进免税农产品准予抵扣的进项税额，按造买价和10%扣除率计算。
另外，运费发票(购固定资产的运费除外)按7%抵进项税。购买废旧物资做原材料的可抵10%进项税。
三.不得从销项税额中抵扣的进项税有：
1.购进固定资产(东北三省除外);
2.用于非应税项目的购进货物或应税劳务;
3.用于免税项目的购进货物或应税劳务;
4.用于集体福利或个人消费的购进货物或应税劳务;
5.非正常损失的购进货物;
6.非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物或应税劳物。
四.增值税抵扣税额
1购入免税农产品扣除率为13%
2运输费用扣除率为7%
3生产性一般纳税人从废旧物资回收公司购入废旧物资扣除率为10%
应交增值税=当期销项税额—当期进项税额
=销项税额—(进项税额—进项税额转出)
=销项税额-(进项税额—进项税额转出—出口退税)—出口抵减内销产品应纳税额
当应交增值税额为负数时，当期进项税额不足以抵扣的部分可结转至下期继续抵扣
【法律依据】：
《中华人民共和国税收征收管理法》
第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条 法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。
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