因为明朝规定是嫡长子继承皇位，但朱见深前两个儿子早就夭折了，三子朱佑樘就是长子，所以传位于朱佑樘。另一原因：明孝宗朱祐樘为人宽厚仁慈，躬行节俭，不近声色，勤于政事，重视司法，所以朱见深才传位朱佑樘。
明孝宗朱佑樘，可以说是明朝276年历史上为数不多的开明之君，其在位期间，明朝自明英宗以来衰落的趋势有所缓解，在经济，政治，军事等方面都取得了相当的成就大有中兴之象。只可惜，这位勤政贤明的君主，只活了三十六岁便病逝，这在一定程度上使得其兴利除弊政治进程没有能够延续下去。
朱祐樘的命其实真不算好，基本上没享过什么福。还没出生就差点被万贵妃堕胎打掉。出生后也生活在黑暗中，20岁的朱祐樘已经历经各种人生艰辛，但即位后的朱祐樘对身边的人并没有抱怨和报复，有的只是感恩的心。
朱祐樘追思自己的亲生母亲，也没有忘记张敏、怀恩和那些帮助过他的人。前任吴皇后曾经对朱祐樘有养育之恩，虽然当时吴皇后养育他的动机并不纯洁，可这依然不影响朱祐樘把吴皇后当作亲生母亲一样来供养。
朱祐樘甚至对曾经想致自己以死地的万贵妃以及她的亲属也是以德报怨。他不仅没有杀了万贵妃的弟弟万喜，还把被抄家入狱的万喜给释放了（很多大臣要求严惩万喜，最好是满门抄斩）。大权在握的明孝宗面对仇恨没有丧失理智，而是选择了宽恕，用一颗慈悲为怀的心去感化所有人。
但明孝宗也对那些假丑恶毫不手软，他肃清了那些所谓的“五大门派”，因为这些机构和这些人只会腐蚀大明王朝。
明孝宗的父亲朱见深是一个得过且过的人，他不想象父亲那样软弱，为了不再让世人经历那些黑暗的日子，朱祐樘用他毕生的精力来打造一个盛世大明。
朱祐樘简直就是一个皇帝中的劳动模范，甚至比他的老祖宗朱元璋还拼命，每天做的事情就是批阅奏章和上朝（早朝和午朝），还会经常去倾听大臣们的意见。朱祐樘几乎不近女色，提倡一夫一妻制，把他父皇朱见深遗留下的“小黄书”给处置了，据说他还发明了牙刷。