南京国民政府和北洋政府并不是同一政府。
南京国民政府是指中华民国在1927年至1949年期间，以南京为首都的政府，由国共两党合作成立。
北洋政府是指中华民国在1912年至1928年期间，以北京为首都的政府，由北洋军阀控制。
两者在时间、地点和控制者上都存在明显的差异。
北洋政府和南京国民政府都是中华民国的不同时期
北洋政府（1912年——1928年）是指中华民国前期以袁世凯为首的晚清北洋军阀在政治格局中占主导地位的中国中央政府，于1913年10月6日袁世凯当选中华民国首任正式大总统后正式形成。
南京国民政府（1927年4月18日～1948年5月20日 ），是中华民国国民政府时期的最高行政机关，由以蒋介石为核心的中国国民党建立，宁汉合流后成为中国国民党唯一政权，1928年东北易帜后成为代表中国的政府，1948年“行宪国大”后改组为总统府。
拓展资料：
中华民国（1912——1949），位于亚洲东部、东临太平洋。是辛亥革命以后建立的亚洲第一个民主共和国，简称民国。
1911年辛亥革命爆发后，革命党在南京建立临时政府，各省代表推举孙中山为临时大总统，1912年元月民国正式建立。 以袁世凯为首的北洋势力主政中国，北洋政府分崩离析后政局动荡不安，孙中山南下广州，召开国民党一大，建立黄埔军校随而建立国民政府，促成国共合作后的孙中山不久病逝。
1926年蒋介石继承孙中山遗志领导国民北伐，意欲统一中国，到1928年东北易帜，国民政府从形式上统一中国， 蒋介石成为继孙中山之后的国民党领袖。 统一之后，民国进进入所谓的“黄金十年”建设时期，此间社会稳定，教育稳步发展、趋于定型。
1937年抗战全面爆发，中国成为反法西斯同盟国，国际地位大大提高，一举成为美英中苏四大国。1949年后因国共内战失利而迁台。