绩效审计没有单一定义,许多国际组织和绩效审计领先国家均对绩效审计有着不同定义。
绩效审计是指由国家审计机关对政府及其各隶属部门的经济活动的经济性、效率性、效果性及资金使用效益进行的审计。
审计程序通常包括制定审计项目计划、审计准备、审计实施和审计终结四个阶段，绩效审计也同样要经过这四个阶段。
项目计划
除了上级审计机关授权项目或政府、人大等部门的指令项目，大部分审计项目都是由审计机关自主确定的。在选择绩效审计项目时一般应考虑三个问题：
被审计项目或单位的影响面大不大？ 被审计项目或单位的风险也即发生问题的可能性大不大？ 预期的审计结果可能引起政府决策层重视的价值是不是大于审计成本？ 如果对这三个问题的回答都是否定的，那么这种项目就可以排除在选择范围以外。原因是它的重要性不高，有限的审计资源应该分配在更为重要的领域。
准备阶段
准备阶段的主要工作包括审前调查、编制审计实施方案、制发审计通知书等。
绩效审计方案的构成内容与一般政府审计项目大体相同，比如审计目标、审计范围、审计方法、审计程序、时间安排和人员分工等。与其它审计项目相比，绩效审计特别强调以下两点：
(1)在编制审计方案之前，应充分了解和掌握被审计单位或项目的基本情况，比如相关法规、协议、工作目标或项目目标、内控制度，单位或项目的产出情况包括产品或服务、社会影响等。
(2)关键工作是建立具体审计目标和绩效标准。对于总体审计目标即经济性、效率性和效果性要进行分解，把它们化成一个个具体的分目标。建立绩效标准是关键，也是一个难点。审计目标和绩效标准都应该具体、明确，具有较强的可操作性。
实施阶段
实施阶段可以分为三个步骤，即收集审计证据、分析评估审计证据并得出审计结论、找出需要改进的地方并初步形成审计建议。三个步骤的划分并不是绝对的，比如在分析证据时发现证据不够充分，就需要再回去补充收集证据，或者在考虑形成审计建议时发现证据不足或分析不当，也需要再回头重做。
终结阶段
审计人员在审计证据分析评价的基础上，形成了审计结论，按照准则的要求编写绩效审计报告。在报告形成之前，审计人员要与被审计单位充分交换意见，落实审计发现。该阶段的具体步骤与一般政府审计项目相同，大致是撰写初稿、征求意见、修改、正式报告。
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