（1）微生态制剂的添加方式
一般粉状饲料使用微生态制剂效果较好，颗粒饲料和膨化饲料在加工过程中，其高温高湿可造成10%～30%的芽孢杆菌的损失，肠球菌可损失90%以上，乳杆菌几乎全部被杀灭，酵母的活细胞损失达99%以上，因此在制粒饲料中不宜用微生态制剂，但可使用耐热（90～100℃）、耐挤压的芽孢杆菌制剂。乳酸菌不耐高温，因此应采用冻干后包被或采用喷雾干燥的方式制成的乳酸菌制剂，活菌数量高，保存期长。
（2）微生态制剂的保存
微生态制剂均为活菌制剂，应密封保存于阴凉避光处，储存时间不宜过长，有效期根据所选用的菌种不同，差异较大，芽孢杆菌类型的微生态制剂的有效期相应比其他类型的有效期长，可达1年左右。
（3）微生态制剂不宜与抗生素同时使用
使用微生态制剂的前后2天应停止使用抗生素，也不宜用吸附剂、酊剂、鞣酸等，以防降低效果或失效。
（4）微生态制剂的适宜添加量
微生态制剂添加到饲料中的比例并不是越高越好，因为兔的胸腺、脾脏对微生态制剂的耐受有一定范围，过高反而是一种应激。不同的微生态制剂应用于不同品种、年龄、健康状况的兔，须达到一定数量才能形成微生物的生物屏障，过多过少均达不到预期的效果，其适宜的剂量有待进行规范化、标准化。
（5）复合微生态制剂中各菌种间的配伍
乳酸菌与酵母共生，它们之间具有协同作用，应用两种微生物制成的微生态制剂属于简单复合微生态制剂。但是有些复合微生态制剂含有多种菌种。多菌种之间是否均起协同作用，菌种的种类、含量配比如何才能使制剂的效果达到最佳，在保质期内它所发挥的作用是否稳定等有待进一步深入研究。
（6）影响使用效果的气候因素
在高温、高湿的夏天，微生态制剂的使用效果要比在气候宜人的季节使用效果更明显。喂微生态制剂的兔排出的粪便比对照组的干燥，从而减少粪臭味，也减少了应激。
（7）使用微生态制剂存在的误区
需要明确的是微生态制剂不是灵丹妙药，并不能包医百病，对某些发生机理尚不清楚，尚无有效疗法的兔病，寄希望于微生态制剂来完全解决，是缺乏科学依据的。多种实验表明，微生态制剂的预防效果要好于治疗效果。在当前饲养环境及饲养技术仍不完善的条件下，抗生素在治疗疾病方面仍起作用，但是随着条件的改善，微生态制剂作为绿色添加剂在家兔养殖业中的作用将日渐突出。
（8）应用前景
尽管我国对微生态制剂的研究和应用比一些发达国家起步晚，但起点比较高，它的开发和应用对我国畜牧业的发展起了积极的推动作用，且潜力很大。微生态制剂不仅具有营养保健作用，而且避免了抗菌药物等在动物体内的残留，是一类绿色环保产品，用了微生态制剂的兔，不仅生长发育快，疾病少，饲料报酬高，而且其产品品质也好。