1、通过评估发现，企业税负率变动异常，或者税负率长期远远低于同行业水平。
2、企业没有进行正常的申报（没有及时报税，报税不完整等，同时还需要注意以下4点）
（1）纳税申报的销售额与防伪税控中的开票销售额以及财务报表中的销售不一致。
（2）连续三个月或者六个月零负申报。
（3）企业的进项税变动率大大高于销项税额变动率。
（4）企业存在大量运费抵扣，收入却是减少的。
3、发票相关数据异常
（1）企业增值税发票增量、使用量与往期比存在异常；
（2）新办企业短时间内，大量领用增值税专用发票，且税负偏低的情况大量领用增值税专用发票；
（3）税收分类编码开错等原因，需要作废多张发票；
（4）公司的供应商因为目前属于失联状态，你们公司买它的增值税发票需要进项税转出；
4、企业员工的经营场地跟收入不匹配。比如员工很多、工作场所很大、但收入很少；或者很少，工作收入却很大等。
5、员工工资长期在5000以下，尤其一些聘请中高端人才的企业，员工平均工资却一直很低，有可能在规避个人所得税。
6、印花税、房产税等税额长期是0。一般而言，在公司正常经营的情况下，在公司正常经营的情况下，印花税和房产税不可避免会发生。
7、成本和毛利率等指标明显不合理，或企业长期亏损却一直不倒闭等。
税负过低我们应该怎么做呢？小编总结部分：
企业方面：
（1）接到税务预警信息后，确定预警信息与企业自身原因有关，应该详细整理相关的数据资料。
（2）分析预警产生的原因
（3）给出合理的解释
（4）最终确定解决方案
（5）接到税务预警信息后，确定预警信息与企业无关，应出具相应证据证明
会计方面：
（1）每月报表报送之前，财务人员都应本着符合业务真实性的原则进行自查
（2）如果经自查，发现税负率偏低的原因是由于自身发生销售行为申报收入不及时，或者有漏报行为，再或者有不应抵扣进项税额的事项没有及时调整的行为造成的，就应该及时调整、补报增值税
（3）当关键指标出现异常时，对于异常原因及时自我检查，内部处理，保证对系统报送的财务报表远离指标异常预警的红线。
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