通用机打发票空白发票作废的方法包括两种：手工作废和系统自动作废。
对于手工作废，首先需要将空白发票的所有联次收回，并在系统中进行作废操作。具体操作步骤可能因不同的开票软件而略有不同，但大致流程为：在开票系统中选择“作废”功能，选择需要作废的发票号码，确认作废。作废后的发票需要进行妥善保管，以备查验。
系统自动作废则是在开票系统中设定一定的规则，如发票开具错误、发票打印不清晰等情况，系统会自动将发票作废。这种方式可以有效避免人为操作失误导致的作废错误。
需要注意的是，作废发票时应严格按照相关规定和操作流程进行，避免因操作不当导致的问题。同时，对于已经作废的发票，需要进行妥善处理，防止流失和滥用。
以上方法仅供参考，具体作废方法可能因不同的开票软件和税务规定而略有不同。因此，在实际操作中，建议纳税人根据具体情况选择适合的作废方式，并严格按照相关规定和操作流程进行作废操作。