首先要向卫生执法部门和工商行政管理部门申请，在他们的指导下完善快餐店的各项卫生设施，并在疾病预防控制中心进行身体健康检查，取得有效的健康证后，在卫生执法部门和工商行政管理部门办理食品卫生经营许可证和工商营业执照后，才能正式营业。
健康证办理程序
体检地点: 当地疾病预防控制中心或经卫生行政部门审批承担预防性健康检查的医疗卫生机构，未经批准擅自开展此项工作的，其出具的体检单卫生监督机构不予受理签发健康证。
一、对象：
从事食品、饮用水生产经营人员、化妆品生产人员、公共场所直接为顾客服务人员。凡患有痢疾、伤寒、病毒性肝炎等消化道传染病(不包括病原携带者)，活动性肺结核，化脓性或者渗出性皮肤病以及其他有碍食品卫生、公共卫生的疾病的，治愈前不得从事接触直接人口食品或直接为顾客服务的工作。
对从事食品生产经营的人员、生活饮用水的供、管水人员、化妆品生产企业生产人员；旅店、咖啡馆、酒吧、茶座、公共浴室、理发店、美容店、游泳场直接为顾客服务的人员每年体检一次。其他场所的直接为顾客服务的人员每两年体检一次。
二、主要检查项目 ：
病毒性肝炎、痢疾、伤寒、活动性肺结核、皮肤病、内外科常规、X光胸透、粪便细菌学培养（某些地区无此项）等。
三、体检和办证流程：
统一使用卫生部制定的《中华人民共和国预防性健康检查用表》，按照卫生监督机构确定的人员到健康体检单位进行预防性健康检查。
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