内蒙古民族大学医学院的教育体系包括临床医学、高级护理、医学影像和医学检验四个本科专业，目前在校生总数为1446人。
在临床医学专业中，本科学制为5年，毕业生将获得医学学士学位，课程涵盖了高等数学、医用物理学、生物化学等医学基础，以及诊断学、内外科学等临床专业课程，旨在培养能够处理常见病和急重症的通科医师，同时具备中医学和预防医学知识，以及外语和计算机技能。
高级护理专业则注重临床护理和管理，学制同样是5年，毕业生需掌握护理学基础、急救护理学等专业知识，能胜任各级医疗机构的临床护理工作。
医学影像专业以4年学制培养高级医学影像专门人才，学生将学习断层解剖学、影像诊断技术等，具备运用各种影像诊断技术进行疾病诊断的能力，毕业后可就业于医院影像科或科研机构。
医学检验专业同样注重理论与实践结合，毕业生掌握医学检验技术，能在各级医疗机构从事检验工作。
以培养蒙医、蒙药人才为主的高等医科学校。前身是1978年在哲里木盟卫生学校基础上建立的哲里木医学院。1980年将筹建中的内蒙古民族医学院与哲里木医学院合并。定名为内蒙古民族医学院。2000年7月，内蒙古蒙医学院与内蒙古民族师范学院，哲里木畜牧学院合并，组成内蒙古民族大学。