先来了解两种滴定管的结构，如图：
酸式滴定管通过一个能转动的活塞控制，碱式滴定管通过一节胶管包裹的玻璃珠来控制。
酸式滴定管的活塞，塞子跟内壁都是磨砂处理过的，涂抹凡士林润滑。由于玻璃会被强碱性溶液腐蚀，形成的硅酸盐有粘性，导致塞子跟内壁粘合在一起。所以酸式滴定管不可盛装强碱溶液、或者水解呈强碱性的溶液。
碱式滴定管的那一截橡胶，不能抵抗强酸、强氧化剂、硫等物质的腐蚀。所以不能用来盛装强酸，高锰酸钾溶液，碘溶液等。
硫代硫酸钠是强碱弱酸盐，Na+不水解。硫代硫酸根水解，结合水电离出来的H+，那么溶液中的OH-浓度上升，溶液呈弱碱性（PH=6.5~8.0）。这个程度的碱，不足以使玻璃形成硅酸盐。
如果仅仅因为它自身水解呈弱碱性的原因，用酸式滴定管是可以的。
硫代硫酸钠跟空气中的CO2或O2反应会产生硫，被水中的微生物分解，也会产生硫。硫会加速橡胶老化。对碱式滴定管有损害。
因此，实验室在实际配置硫代硫酸钠标准液的时候，所用的水要经过沸煮（15分钟以上），以赶走水中溶解的CO2，并杀死微生物。同时加入少量碳酸钠，调节标准液的PH值（9~10）。防止使用、贮存过程中与空气接触，CO2导致标准液变质，并抑制微生物的滋生。
硫代硫酸钠标准液都是现用现配的，如果确实配多了，要贮存。那么放入棕色试剂瓶，存储期限不得超过14天。使用前观察溶液是否浑浊，若浑浊则失效，弃用。
若不浑浊，也须重新标定后才能使用。
因为加了碳酸钠升高PH值的缘故，溶液碱性较强。不宜使用酸式滴定管。原因是这个，而非其本身水解所致。
另外，由于都是现配现用，其中含硫量很低，即使用多了腐蚀胶管也没什么关系。因为胶管很便宜，买来一节胶管可以分多次使用。但是酸式滴定管的塞子就不能换，凡是这种磨砂的塞具，都是一塞对应一孔。坏了就只能买新的。
综上所述，从化学性质，经济方面考虑，应用碱式滴定管。