根据上述职责，省质量技术监督局设13个内设机构：
（一）办公室。
负责机关文电、信息及信息安全、安全保卫、保密、信访工作；负责机关财务、资产管理工作；负责机关日常工作的协调和督查；负责应对突发事件方案的制定、演练和组织实施；承担政务公开、新闻发布和宣传报道工作。
（二）计划财务审计处。
拟订并组织实施全系统计划、财务和基本建设的内部管理制度；负责全系统财务预、决算的编制、执行及日常核算；管理全系统各类资金、装备、国有资产、基本建设、政府采购及制装工作；负责全系统行政事业性收费、罚没监缴及票据管理工作；制定全系统内部审计制度并组织实施；负责全系统内部审计工作。
（三）科学技术处。
拟订相关科技发展规划并组织实施；组织开展相关科研、技术引进等工作；提出全系统技术机构及实验室建设规划、计划和科研经费年度计划方案并监督执行；承担全系统的统计工作。
（四）法规处。
负责组织起草相关地方性法规、规章草案；组织实施有关法律、法规宣传教育培训工作；拟定全系统行政执法工作的内部监督制度，组织实施行政执法监督检查；承办案件审理、行政复议和行政应诉工作；负责行政执法人员资格管理；承担有关规范性文件审核工作；负责地理标志保护产品申报及管理工作。
（五）人事处。
负责全系统的干部人事管理、教育培训和职业资格工作；协管哈尔滨市质量技术监督局领导班子；负责全系统的出国人员政审和外事工作。
（六）质量管理处。
负责组织实施全省质量振兴的政策措施和质量奖励制度；推进名牌发展战略；组织分析全省产品质量状况，建立并实施全省产品质量诚信制度；负责工业产品生产许可证管理；组织全省重大产品质量事故的调查并提出整改意见；承办重大工程设备质量监理有关工作；组织落实产品安全及产品质量担保制度；承担产品防伪的监督管理工作。
（七）产品质量监督处。
拟订和执行产品质量安全监督工作制度;组织实施产品质量监督抽查；指导和协调产品质量的行业、地方和专业性质量监督；拟订重点监督的省内产品目录并组织实施；承担产品质量安全强制检验和风险监控工作；负责机动车安全技术机构资格许可及监督管理；监督管理产品质量检验机构及仲裁检验、鉴定，负责调解质量纠纷。
（八）执法督查处。
组织查处违反标准化、计量、质量、特种设备、认证认可等法律法规行为；组织开展全省产品质量安全专项整治工作，按分工打击假冒伪劣违法活动；承担跨市（地）案件的查处和大案要案的督查督办工作。
（九）食品生产监管处。
组织实施生产加工环节的食品、食品相关产品和化妆品的质量安全监管、风险监测、市场准入制度和强制检验工作；负责食品生产许可检验机构和人员的资质管理；组织实施生产加工环节的食品安全监督管理计划、专项整治和监督管理；拟订食品生产加工企业质量安全等级评价和分类分级监管制度，按规定权限组织调查处理相关质量安全事故。承担化妆品生产许可和强制检验工作。
（十）标准化处。
负责组织制定、修订地方标准（食品安全地方标准除外）；组织贯彻实施国家标准、行业标准和地方标准（食品安全地方标准除外）；对标准的实施进行监督；负责企业标准（食品安全企业标准除外）备案工作；指导建立健全标准体系和采用国际标准、国外先进标准等企业标准化工作；组织开展农业标准化与监测工作；监督管理全省组织机构代码、物品编码和标准化信息工作。
（十一）计量处。
负责推行国家法定计量单位；管理全省计量标准；组织制定地方计量检定规程和计量技术规范；负责管理计量器具，组织全省量值传递、强制检定和比对工作，规范和管理计量校准工作；监督管理商品量、市场计量行为和计量仲裁检定；监督管理计量检定机构、社会公正计量机构及计量检定人员的资质资格；负责计量器具新产品定型鉴定、型式评价和制造、修理计量器具许可及监督管理；指导建立健全计量检测体系，依法开展能源计量工作。
（十二）认证认可处。
负责对向社会具有证明作用的数据和结果的实验室和检查机构进行技术能力评审、资质认定和监督管理；负责组织对认证机构和认证人员的认证行为、认证企业认证有效性、认证证书及认证标志使用进行监督检查；组织对强制性认证产品实施监督检查；对认证咨询机构、认证培训机构进行备案管理；依法负责对质量监督检验机构授权、验收及监督管理工作；依法规范和监督市场认证行为。
（十三）特种设备安全监察处
按规定负责锅炉、压力容器、压力管道、电梯、起重机械、客运索道、大型游乐设施、场（厂）内专用机动车辆等特种设备的安全监察、监督工作；负责对特种设备设计、制造、安装、改造、维修、使用、报废、进出口以及移动式压力容器、气体充装、锅炉水处理、锅炉化学清洗单位和检验检测机构实施行政许可及安全监察；按规定会同有关部门组织调查组处理特种设备事故并进行统计分析，监督管理特种设备作业人员和检验检测人员的资质资格；监督检查高耗能特种设备节能标准的执行情况。
机关党委。 按党章规定设置，负责机关和直属单位的党群工作；指导全系统思想政治工作和精神文明建设工作；负责组织协调目标责任制工作。
离退休干部工作处。负责机关离退休干部管理和服务，指导直属单位的离退休干部工作。
纪检监察机构。为省纪检委（监察厅）的派驻机构，人员编制、领导职数单列。
