南京挹江门，最初是市民为进出城方便而在城墙上挖开的一个门洞，称作土城门。
1912年中华民国在南京成立，随着中国东部地区经济的发展及铁路的贯通，经铁路由下关转运的货物大量增加。水路码头和铁路的所有货物入城都是从江宁马路，由下关江边码头经仪凤门入城。由于大马路一带已无足够的岸线，其他地段又因交通阻隔、地势低洼而无法使用，致使经过的货物入城不畅。为此，各界人士呼吁集资，在下关垫地筑路，开辟新的街市。
1914年，下关商埠局帮办金鼎首先倡议，为了繁荣下关码头岸线，应增开城门，填平洼地，修筑马路，打破交通限制，这个倡议得到了下关商界普遍附议。
1914年5月，在时任江苏省民政长韩国钧的支持下，南京地方当局在仪凤门西南的城墙上破墙动工，从城门内八字山取土垫筑城门口到江边码头的道路，填平小南河（今热河路），垫成基地2.7万平方米。新开单孔城门一座，从而缩短了从下关江边进城的路程。
1915年3月城门竣工，全部工程耗银币1.5万元。后小南河基地标价银币4.7万元售出，填补工程用款。此工程缩短了进程路线，便利了码头交通，促进了下关港埠的发展。据传下关商埠局开辟城门之时，因为韩国钧是泰州人（韩国钧是海安人，当时海安属于泰州），泰州古称“海陵”，这座南京的城门就被命名为“海陵门”。《新京备乘》卷上记载：“（韩国钧）就仪凤门西偏，复辟一门。韩泰州人，故名‘海陵门’。”
1928年7月，国民政府下令改朝阳门为中山门、仪凤门为兴中门、海陵门为挹江门、神策门为和平门、丰润门为玄武门、聚宝门为中华门、正阳门为光华门。
1929年，为迎接孙中山先生从北平西山碧云寺南下的灵榇奉安钟山，将挹江门单孔拱门改为三孔拱门。同年4月，国民政府考试院院长戴季陶题写“挹江门”匾额。挹江门时为下关入城的重要通道。民国时期，挹江门的三个城门券都安装了厚木料制作的板门，并设有关卡检查来往行人和车辆。
1930年，挹江门上建造城楼。
1937年，日军进攻南京时，挹江门城楼被炸毁。日军曾在此一带进行过惨绝人寰的杀戮，后红十字会执拾罹难者遗骨于此共葬，现绣球公园内立有纪念处一座。
1945年抗战胜利，挹江门城楼重建的工程就开始，1946年彻底竣工。
1949年4月23日，人民解放军主力部队由下关登岸经挹江门进入南京，并于当夜占领南京总统府，为纪念中国人民解放军渡江胜利这一历史事件。
1984年4月23日，南京市人民政府决定在挹江门城楼上辟建渡江胜利纪念馆，邓小平同志书写馆名。
2009年4月“渡江胜利纪念馆”异地复建，经多次修缮，挹江门城楼保存完好。
