大的方向上就是西医和中医疗法，至于那个好，要看发病情况，急性期建议用西医疗法。支原体是介于细菌与病毒之间的微生物，没有细胞壁。有些抗生素的治疗原理是作用于细胞壁，破坏细胞壁以后，引起病原体死亡。因为支原体没有细胞壁，所以有些抗生素对支原体感染是无效的。
治疗时，必须要根据药敏实验选择相应有效的抗生素，常用的有阿奇霉素等，急性期时可以用，见效快，但抗生素不能长期用，容易产生抗药性和耐药性，且有副作用，中药不会产生抗药性和耐药性，症状缓和后可以喝利尿消炎药丸配合清淡饮食，戒酒，不吃辛辣刺激食物。另外还可以同时进行一些按摩和食疗方法。治疗是一方面，日常保健也很重要，要注意：1、个人卫生，洗浴用品等不要混用，贴身衣物勤换洗，而且要杀毒消菌。
2、不要久坐或长时间骑车，办公室人员每隔一个小时要起来活动下，每天晚上可用热水坐浴熏蒸，加强会阴部血液循环
3、不要憋尿，多喝温水，多运动，让身体中的毒素随尿液排出体外
4、不要熬夜，晚上是身体排毒时间
5、支原体感染主要通过性接触传播，所以治疗期间，一定要避免性行为，配偶或伴侣也应一起接受治疗。
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