1.寄主抗病性
目前尚未发现对玉米小斑病免疫的品种，但品种间抗性差异很显著。大面积种植感病品种或杂交种是导致小斑病流行的一个重要因素。例如，美国20世纪70年代初大面积种植感病的T型雄性不育细胞质的杂交种，导致小斑病大流行。在我国，普遍种植农家品种时，由于品种的多样化，遗传种质复杂，因而小斑病发生很轻。20世纪50年代末和60年代初，河北、安徽和黑龙江等地曾先后在T型雄性不育细胞质玉米上发生严重的小斑病，但当时并未引起重视。到20世纪60年代中期，小斑病严重流行，造成重大损失，后因推广抗病品种，特别是近几年来，随着丹玉13、掖单13和中丹2号等一些新的抗病品种的推广，病害又得到控制，并趋于稳定。但病菌小种发生变异、导致品种抗性丧失和病害暴发流行的可能性依然存在。
同一品种的植株不同生育期及不同叶位的叶片对病害的抗性差异显著。一般来说，新叶生长旺盛，抗病力较老叶和苞叶强；玉米生长前期较后期抗病。因此，玉米拔节前发病多限于下部叶片；抽雄以后，玉米营养生长停止，叶片逐渐衰老，病势往往由下向上发展，病叶率和每叶病斑数急增，病情指数急剧上升。
2.气候条件
在有足够菌源和种植感病玉米品种的前提下，决定小斑病发生轻重的关键因素是气候条件中的温度、湿度、雨日和雨量等。气温在15～20℃时，病害发展很慢，20℃以上时渐快。所以，如果6月份气温比常年高，又有较多雨水，病菌菌量得到积累，病害便会提早流行。常年7～8月份，月平均温度在25℃以上，适于小斑病的发生蔓延，此时发病轻重主要取决于这个时期的降雨量和相对湿度。如果此时雨日、雨量、露日和露量较多，相对湿度高，病害容易流行。总之，如果6、1、8月3个月的气候条件都有利于发病，则菌量增长快，病害流行早、流行期长。
3.栽培管理
地势低洼、排水不良、土壤潮湿、土质黏重、种植密度大、通风透光不良等凡使田间湿度增大、植株生长不良的因素都有利于发病。土壤贫瘠、漏肥严重、后期缺水、导致植株脱肥早衰的田块，往往发病较早、较重。一般坡地比平地发病重。
春玉米与夏玉米套种，可加重病害。夏玉米发病重于春玉米，夏玉米晚播田重于早播田。这主要与菌量积累有关。油菜茬和大麦茬的夏玉米上病害一般轻于小麦茬。主要原因是前者茬口早、播期早。
玉米小斑病为弱寄生菌。玉米拔节和抽穗期，如果脱肥，可导致植株生长衰弱，抗病力下降，易被病菌侵染，加重发病。