须明确问题之一：工程风险的确定和分担。
应明确“采用工程量清单计价的工程，应在招标文件或合同中明确风险内容及其范围(幅度)，不得采用无限风险、所有风险或类似语句规定风险内容及其范围(幅度)。”
进一步表述则为明确招标工程以投标截止日前28天为基准日，其后国家的法律、法规、规章和政策发生变化影响工程造价的，应按省级或行业建设主管部门或其授权的工程造价管理机构发布的规定调整合同价款。
此外如业主要求使用风险限定性较强的合同，应在合同中明确约定风险费用的计算方法、金额等。
须明确问题之二：因不可抗力事件导致的费用的分摊
应按明确以下原则分别承担并调整工程价款。1.工程本身的损害、因工程损害导致第三方人员伤亡和财产损失以及运至施工场地用于施工的材料和待安装的设备的损害，由发包人承担；2.发包人、承包人人员伤亡由其所在单位负责，并承担相应费用；3.承包人的施工机械设备损坏及停工损失，由承包人承担；4.停工期间，承包人应发包人要求留在施工场地的必要的管理人员及保卫人员的费用，由发包人承担；5.工程所需清理、修复费用，由发包人承担。
须明确问题之三：合同工期内材料价格波动如何调整合同价款
应当在施工合同中事先明确约定（1）可调价材料类别名称，例如：钢材、砼、水泥、电线、电缆、沥青、石材、铝合金等等。可调价材料种类的确定应以其价值占工程造价比重较大、其价格波动对工程造价影响明显者为原则；确定原则可明确如下：以及其价值占单位专业工程分部分项工程费5%以上者。计算公式如下：占比（%）＝某材料单位专业工程总数量（包括变更调整数量）×中标单价／中标的单位专业工程分部分项工程费（包括变更调整部分）×100%。（2）业主及承包人承担的材料上涨或下跌的风险幅度，可为5%；（3）、调整材料价差时基准期材料价格及施工期材料价格的取定，是以指导价为准还是以实际投标价或采购价为准；（4）、超过合同约定的风险幅度值时的调整方法施工期间可调价材料价格的涨、跌幅度以招标控制价所采用的月份价格为基础，涨、跌幅度在5%以内（含5%）时，其差价由承包人承担或受益；涨、跌幅度超出5%时，其超出部分的差价由发包人承担或受益，计算公式可如下：
①上涨超出5%时，差价（正值）＝（施工期间可调价材料加权平均价－招标控制价所采用的月份价格×1.05）×（1－该材料单价让利幅度）；
②下跌超出5%时，差价（负值）＝（施工期间可调价材料加权平均价－招标控制价所采用的月份价格×0.95）×（1－该材料单价让利幅度）。
其中施工期间可调价材料加权平均价=Σ（每月实际使用量×当月价格）／该材料总用量。当每月实际使用量无法确定时，可以根据当月完成的工作量分析出的数量计算；当某要素单价让利幅度无法确定时，可以采用中标让利幅度。
（5）明确预定因发包人或承包人原因造成工期延误的，延误期间超出合同约定工程的时段遇价格波动造成的差价损失由责任方承担。（6）材料差价应根据费用定额计价规则计取相关费用和税金，并作为追加（减）合同价款和工程进度款同期支付。
须明确问题之四：合同工期内预算人工工资单价变动时如何调整合同价款
人工单价目前属于国家政策性文件，应根据有关文件要求进行调整。合同应明确投标报价即合同中人工工资单价金额以及定额工日数量，并在此基础上根据有关文件规定调整人工工资单价，同时原投标报价或签订施工合同时工资单价若有让利没有按预算人工工资单价报价的，工资单价调整时应扣除原让利部分，此外人工工资差价部分还应根据费用定计价规则规定计取相关费用、税金等。
须明确问题之五：竣工结算时工程数量的调整原则
招标文件及施工合同中应明确招标文件中的工程量清单标明的工程量是一个预计工程量，是投标人投标报价的共同基础，不应作为竣工结算的依据，竣工结算的工程数量应按发、承包双方在合同中约定应予计量且实际完成、双方仍可的工程量确定。
须明确问题之六：竣工结算时工程量清单中综合单价的调整原则
招标文件及施工合同中应明确施工方投标报价的含综合单价报价的清单为已标价的工程量清单，应为施工合同的附件，其中的综合单价应为合同单价，作为竣工结算的依据。
须明确问题之七：工程量清单中工程量增减时综合单价的调整原则
招标文件及施工合同中应同时明确非承包人原因引起的工程量增减，该项工程量变化在合同约定范围以内的，应执行原有的合同综合单价；该项工程量变化在合同约定幅度以外的，其综合单价及措施项目费应予以调整。
招标文件及施工合同首先应明确约定工程量增减导致合同价款即综合单价调整的前提条件，即“当工程量清单项目工程量的变化幅度超过10%，且其影响分部分项工程费超过0.1%时”，即应调整其工程价款，第二应约定合同价款中重新计算综合单价的工程量的范围，，即工程量增加时超过10%时，原工程量清单中的工程量部分执行原合同价，超出部分可调整价格；工程量减少时超过10%，剩余的部分可以调整价格。一般调整的原则是：工程量增加，综合单价调低；工程量减少，综合单价调高。第三应约定合同价款中工程量增加或减少时新综合单价的确定原则和方法，包括套用定额，价格信息的采用，管理费、利润的取定，是否考虑让利幅度，新增部分分部分项工程费是否计取措施费、规费、税金等。
须明确问题之八：施工中出现施工图纸(含设计变更)与工程量清单项日特征描述不符时价款的调整原则。
招标文件及施工合同中应明确约定施工中出现设计变更或是由于招标时工程量清单描述有误，导致设计施工图纸与工程量清单项日特征描述与不符的，发、承包双方应按新的项目特征确定相应工程量清单项目的综合单价。也即合同中应约定遇到此类情况应按工程量清单中的工程数量及已标价工程量清单中的综合单价（即合同单价）扣除原有报价，新的综合单价的确定则应由承包商根据投标报价的口径重新计算，由业主认可之后进行调整。
须明确问题之九：产生新的工程量清单项目其工程价款的调整原则
招标文件及施工合同中应明确约定，由于招标文件中工程量清单的漏项，或是非承包人原因的工程变更，造成增加新的工程量清单项目，其对应的综合单价按下列方法确定：1.合同中已有适用的综合单价，按合同中已有的综合单价确定；2.合同中有类似的综合单价，参照类似的综合单价确定；3.合同中没有适用或类似的综合单价，由承包人提出综合单价，经发包人确认后执行。
但在施工合同的签订过程中，对于新增工程量清单项目综合单价的计算方法和计算口径尤其是第3点内容应予以进一步明确，包括其计价依据、工料机价格（按投标当月的信息价，还是施工当月的信息价以及施工方的投标价，还是相对应的指导价格？）、是否计取相关规费、是否计取相关措施费以及让利幅度等，这样才能在工程结算时有完整的计价依据而减少造价纠纷争议产生的可能性。
须明确问题之十：措施项目费用结算原则
招标文件及施工合同中应明确约定，因分部分项工程量清单漏项或非承包人原因的工程变更，引起措施项目发生变化，造成施工组织设计或施工方案变更，措施项目费用应作相应调整。
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