二本医学院包括：
1. 南京医科大学
2. 首都医科大学
3. 重庆医科大学
4. 温州医科大学等。这些医学院均为二本招生，且拥有较高的教育质量和声誉。
解释如下：
二本医学院指的是在本科第二批招生中的医学院校。这些学校在国内医学教育领域占有重要地位，为医学领域培养了大量的专业人才。
南京医科大学，作为一所历史悠久的医学院校，拥有完善的医学学科体系和先进的教学设施，其教学质量和科研水平在国内均享有较高声誉。
首都医科大学，位于北京，是一所综合性医科大学，拥有丰富的教育资源和高水平的师资队伍。该校的医学专业在国内具有较大的影响力。
重庆医科大学，位于重庆市，是一所以医学为主，多学科协调发展的医学院校。该校在医学研究和教学方面成果显著，为国内外输送了大量的医学人才。
温州医科大学，在医学教育、科研和服务方面都有较高的水平，尤其在某些医学领域有着突出的优势。该校的二本招生专业也备受考生关注。