2005年，南通市辖2个市辖区、2个县；代管4个县级市。
南通市 面积8544平方千米，人口774万人（2004年）。
崇川区 面积 215平方千米，人口 67万人。邮政编码226001。
港闸区 面积 134平方千米，人口 18万人。邮政编码226001。
海门市 面积1148平方千米，人口102万人。邮政编码226100。市人民政府驻海门镇。
启东市 面积1191平方千米，人口113万人。邮政编码226200。市人民政府驻汇龙镇。
通州市 面积1343平方千米，人口127万人。邮政编码226300。市人民政府驻金沙镇。
如皋市 面积1531平方千米，人口143万人。邮政编码226500。市人民政府驻如城镇。
如东县 面积1872平方千米，人口108万人。邮政编码226400。县人民政府驻掘港镇。
海安县 面积1110平方千米，人口 96万人。邮政编码226600。县人民政府驻海安
南通地（专）区 1953年1月1日，江苏省人民政府成立，设南通专区。南通专区辖如皋、如东、海安、启东、崇明、南通、海门等7县，专署驻南通市。
1958年，原由省辖的南通市，划归南通专署领导。崇明县划归上海市。南通专区辖1市6县。
1962年，南通市改为省辖市。南通专区辖6县。
1970年，南通专区改称南通地区，专署驻南通市。辖海安、如皋、如东、启东、海门、南通6县。
南通市 1953年1月1日，南通市为省辖市。1958年，南通市划归南通专区领导。1962年，南通市仍改为省辖市。
1983年实行市管县体制，南通地区的海安、如皋、如东、启东、海门、南通6县划归南通市领导。市区设城中、港闸合并为南通市城区。南通市共辖6县2区。
1989年11月起，经国务院批准，先后撤销启东、如皋、南通县，改设启东、如皋、通州市。
1991年5月，经国务院批准，南通市城区更名为崇川区，郊区更名为港闸区。南通市区辖3市3县2区。
1993年撤销南通县，以其原辖区域设立通州市。1994年撤销海门县，以其原辖区域设立海门市。
2001年经省人民政府批准，将通州市的观音山镇、小海镇、竹行镇、通州市良种场划归南通市崇川区管辖；将通州市行政区域范围内的南通农场（隶属省农垦集团公司）、东方红农场（隶属省军区）划入南通市崇川区行政区域。 其中：小海镇、竹行镇、良种场、种畜场整建制划进市区并委托富民港办事处管辖，南通农场（省属）和东方红农场（省属）划入富民港办事处行政区划范围内。行政区划调整后市区总面积达381.6平方千米，总人口达75.98万人，分别比调整前增加144.82平方千米，12.75万
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