蒸馏水和纯净水的区别有：
1、蒸馏水是采用蒸馏法或其他多层过滤加工制成，将有害物质及微生物去除，但同时也去除了钾、钙、镁等人体所需的矿物质。另外，在这个看似十分严密的生产过程中也隐藏着一定的风险。自来水中含有氰化物和挥发酚，这两种物质容易挥发，用蒸馏法生产则会浓缩这两种物质的含量。在蒸馏的过程中，如果方法不注意，可能会存在风险。
对于有肾结石的人来说，选择无矿物质的蒸馏水为好，但对于健康人群，则不建议过多饮用蒸馏水。
2、纯净水就是以生活饮用水或符合生活饮用水卫生标准的水为水源水，经过初滤、精滤以及反渗透过滤、杀菌等净化后可供直接饮用的净水。通过纯净水设备过滤，水中的有毒有害的重金属、大部分有机污染会被去除，但杂质被去除的同时，水中90%左右的微量元素会被过滤掉。
从健康的角度来看，白开水是目前认为最符合人体需要的饮用水，清洁无菌，煮沸后，水质和水硬度得到改善，保存适量矿物质，是最经济的健康饮品。它不含卡路里，不用消化就能为人体直接吸收利用。
一、定义不同
蒸馏水是指经过蒸馏、冷凝操作的水，蒸二次的叫重蒸水，三次的叫三蒸水。纯净水指的是不含杂质的H₂O，是纯洁、干净，不含有杂质或细菌的水。是符合生活饮用水卫生标准的水。
二、制作方法不同
蒸馏水是采用蒸馏法或其他多层过滤加工制成，将有害物质及微生物去除，但同时也去除了钾、钙、镁等人体所需的矿物质。纯净水是将天然水经过多道工序处理、提纯和净化的水。除去了对人体有害的物质、除去细菌，可直接饮用的水。
三、饮用对象不同
健康人群不适宜过多饮用蒸馏水，但肾结石的人建议选择无矿物质的蒸馏水为好。纯净水长期饮用会造成微量元素缺乏，降低人体免疫力，增加心脑血管患病的风险。
运动量大、出汗多的人（如运动员、炼钢工人）等人群不适宜饮用纯净水，因为无法从中摄取多种微量元素。