扇贝里不能吃的部分包括：扇贝的壳、扇贝的黑色部位、扇贝的肠胃等消化器官。
扇贝是一种海鲜产品，其内部结构包括贝壳、肌肉以及消化系统器官等部分。我们在食用扇贝时主要关注的是其肉质部分，但确实存在不宜食用的部分。具体如下：
扇贝壳因其坚硬不能直接食用，烹饪前一般需要进行清洗去除。虽然外壳对口感没有直接影响，但在食用前一定要确保其被完全清理掉。此外，扇贝内部通常会包裹着一团黑色的物质，这是扇贝的内脏部分。内脏中含有一些废物和毒素，因此在食用前应将其清除。另外，扇贝内部还有一些消化器官如肠胃等，这些部位可能存在泥沙等不洁物质，同样需要在烹饪前彻底处理干净以确保食品安全。
综上所述，食用扇贝时主要关注的是其鲜美且可食用的肉质部分。对于上述不宜食用的部分如壳、内脏和消化器官等需要在烹饪前进行仔细处理以确保食用的安全和健康。因此购买扇贝时需要注意其新鲜程度，并在烹饪前进行充分的清洗和处理。