1.问：一般纳税人从小规模纳税人取得的农产品专用发票能否抵扣进项税额？是扣3%还是9%还是10%？
答：可以扣。
根据财税[2017]37号文件第二条第(一)项规定：从按照简易计税方法按照3%的税率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和11%的扣除率计算进项税额。目前农产品11%的税率改为9%，所以从小规模纳税人取得的农产品专用发票可以按9%或10%的税率抵扣进项税额。
为生产或者委托加工购买农产品，税率为13%的货物，可以按照10%计算扣除，其他情况可以按照9%计算扣除。
2.问：一般纳税人从小规模纳税人取得的农产品普通发票能否抵扣进项税？
答：不能，从小规模纳税人购进的农产品，只能取得专用发票才能抵扣，取得的普通票不能抵扣进项税额。
3.问：一般纳税人取得的农产品免税发票可以抵扣进项税吗？
答：从农业生产者处取得的农产品收购发票或销售发票是免税的，这种免税发票可以抵扣进项税额。按9%或10%的税率计算进项税抵扣。
在“公司农户”经营模式下，纳税人回收并转卖畜禽，属于农业生产者销售自己的农产品；农民专业合作社销售其成员生产的农产品，视同农业生产者销售自己生产的农产品，免征增值税。
4.问：农业生产者开具的农产品发票是免税的，或者小规模开具的专用发票是3%。为什么可以扣9%或者10%？我会违规少缴税吗？
答：不用担心这会导致违规。进项税抵扣9%或者10%是完全合法合规的。这是因为国家为了鼓励农业生产者的产品打开市场，让他们在市场上有价格优势，所以出台了税收支持政策。
5.问：农产品有哪些？
农产品是指种植业、养殖业、林业、畜牧业和水产业生产的各种动植物的初级产品。包括未加工的产品。
总结：
可以享受农产品加计扣除政策的票据有三种：
一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书。
小规模纳税人开具的农产品增值税专用发票。注意，小规模纳税人开具的增值税普通发票不能计算抵扣进项税额，只有专用发票可以。
农产品收购发票或销售发票。必须注意农业生产者销售自产农产品开具的免税普通发票。纳税人在批发和零售环节销售免税农产品开具的免税发票不能抵扣。
相关问答：从小规模纳税人购进产品进项税怎么计算
从小规模纳税人购进产品进项税按3%计算。小规模纳税人可以去税局代开3%的增值税专用发票，代开的专票也是可以抵扣的，但只能代开3%的专票。1、以前的税率小规模纳税人被划分为工业和商业两类，征收率分别为6%和4%。而实际上，这些小规模纳税人混业经营的情况非常普遍，根本无法区分哪些是商业小规模纳税人，哪些是工业小规模纳税人；2、现在的税率修订后的增值税条例对小规模纳税人不再设置工业和商业两档征收率，将小规模纳税人征收率统一降至3%。【法律依据】《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。下列进项税额准予从销项税额中抵扣：（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。进项税额计算公式：进项税额=买价*扣除率（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。第十一条小规模纳税人发生应税销售行为，实行按照销售额和征收率计算应纳税额的简易办法，并不得抵扣进项税额。应纳税额计算公式：应纳税额=销售额*征收率小规模纳税人的标准由国务院财政、税务主管部门规定。