1、编制内的工作人员的工资和福利待遇由当地财政部门发放，编制外用工的工作人员的工资是由事业单位本单位发放，编制内与编制外工资和待遇相差较大。
2、编制内人员的人事关系由当地人事局管理，编制外用工的人事关系由事业单位本单位或人才交流中心管理。
3、编制内用工如果工作人员不犯错误一般不存在被解聘，比较稳定， 至于编制外用工事业单位会根据单位实际效益决定工资待遇和是否解聘。现在的事业单位无论是在编的还是编制外的都是采用聘用制，有编制相对有保障一些。编制内的人稳定性要比编制外的人高，同时编制内的人一般工作心态也比较好，毕竟编制内的人所受到的相关保障要远远高于编制外的人，他们一般都是把自己的工作当成是一个终身工作，而编制外的则完全不一样，因为保障程度一般，导致他们很难把情绪稳定下来，只要受到了稍微一点的区别对待可能都会萌生离职的想法。
4.首先，编制内的人享受到的相关福利待遇是很多编制外的所没有的，这其中包括个人劳动报酬、工龄补贴等等方面。编制内的员工因为有足够的保障，所以他们完全不用担心这些相关福利不会发给他们，而编制外的员工虽然说和编制内的员工同工同酬，但是在某些方面还是会有一点区别的。可能一开始觉得没有什么，时间久了总会出现一些想法。毕竟很多人都不会愿意看见明明做的一样的事情却拿不一样的薪水这种情况。
5.最后，编制内的人员相比较编制外人员获得晋升的可能性要大得多，一般情况下编制外人员想要获得除非自己平时表现的特别优异，否则也是没有什么大的机会的。
法律依据：
第十五条 机构编制管理机关应当按照编制的不同类别和使用范围审批编制。地方各级人民政府行政机构应当使用行政编制，事业单位应当使用事业编制，不得混用、挤占、挪用或者自行设定其他类别的编制。
第十九条 地方各级人民政府议事协调机构不单独确定编制，所需要的编制由承担具体工作的行政机构解决。
第二十六条 有下列行为之一的，由机构编制管理机关给予通报批评，并责令限期改正；情节严重的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分：
（一）擅自设立、撤销、合并行政机构或者变更规格、名称的；
（二）擅自改变行政机构职责的；
（三）擅自增加编制或者改变编制使用范围的；
（四）超出编制限额调配财政供养人员、为超编人员核拨财政资金或者挪用其他资金安排其经费、以虚报人员等方式占用编制并冒用财政资金的；
（五）擅自超职数、超规格配备领导成员的；
（六）违反规定干预下级人民政府行政机构的设置和编制管理工作的；
（七）违反规定审批机构、编制的；
（八）违反机构编制管理规定的其他行为。
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考