我是做水处理的，首先可以告诉楼主：你所喝到的这些水都是符合国家的饮用水水质标准的，所以关于危害方面先不用太担心。
简单说一下自来水、纯净水和矿泉水的不同。
自来水是经过过滤消毒等简单处理的地表水或者井水，水质在三者之中是最低的，但是放心，烧开后喝是没有问题的，但是要注意不能重复烧开。最大的优点是便宜。
纯净水就好的多（如果你购买的是合格产品），一般是经过反渗透处理，里面的细菌病毒都没有了，当然，矿物质一般也没剩什么了。国外的饮用水和现在国内高档小区的直饮水就是反渗透处理的纯净水。虽然现在市面上有人攻击纯净水对健康不好，但是事实是人体所需的绝大部分矿物质都是通过食物摄取的，因此，喝纯净水没有问题。因为处理工艺相对复杂，所以价格比自来水高多了。
瓶装矿泉水也不错，主要是水源地好呀，天生丽质，所以装在瓶子里面卖，价钱也最高，呵呵。
参考资料：我就是做水处理的