1．普通光学显微镜。光镜的机械部分由镜座、镜臂、载物台、镜筒、物镜转换器和调焦螺旋等组成；光学部分包括目镜、物镜、聚光器和
反光镜。目镜有放大5倍、8倍、10倍、15倍几种。物镜一般有10倍、20倍、40倍和100倍（油浸镜）几种。光镜的放大率等于物镜和目镜放大倍数的乘积。
2．暗视野显微镜。用于观察在亮视野下因反差太小或分辨率不足的微细结构或颗粒。这种显微镜主要是由一个特殊的暗视野集光器，使光线不直接进入物镜，故呈暗视野。用来观察不染色的新鲜细胞涂片或放射自显影标本中的银颗粒分布等。
3．相差显微镜。主要用于观察组织培养中的活细胞，这种不染色标本，其反差小，在一般光镜下，其结构分不清楚。相差显微镜将细胞各种结构对光线所产生的不同折射作用，转换成光密度差异，使镜下结构反差明显，影像清楚。如将这种显微镜改装成目镜在下，光源在上，则称为倒置相差显微镜。用以观察贴附于培养瓶的活细胞，效果更好。
4．
荧光显微镜。用以观察有自发荧光或经
荧光素染色或标记的细胞和组织。这种显微镜一般是以高压汞灯产生的短波紫外线为光源，荧光物质在紫外线照射下激发出各种颜色的荧光，借此研究该荧光物质的分布，该显微镜附有激发、吸热、阻断等滤片系统。