在进行炭疽杆菌微生物学检查时，样本的采集十分重要。对于皮肤炭疽，需要收集患者的脓液和渗出物；对于吸入性炭疽，样本为患者的咯痰；对于肠炭疽，粪便样本是检测对象。此外，血液样本也是常规采集的一部分。但需要注意的是，对于动物的尸体，不应进行解剖，而是可以选取耳朵或舌尖的一小部分进行送检。
直接涂片和沙黄荚膜染色是初步诊断的手段，通过观察标本的形态和荚膜特征。然而，确诊炭疽杆菌需要进一步的实验室操作。首先，进行血平板分离培养，将样本在37℃的环境中孵育12到15小时，然后观察并挑选可疑的菌落。接着，进行一系列的生化试验，如青霉素串珠试验、噬菌体裂解试验以及在碳酸氢钠平板上进行二氧化碳培养的荚膜肿胀试验。
为了与其它需氧芽孢杆菌进行准确鉴别，还会进行小白鼠致病力试验。这一系列严谨的实验步骤，确保了对炭疽杆菌的准确诊断，从而为治疗提供科学依据。
炭疽杆菌（Bacillus anthraci）属于需氧芽胞杆菌属，能引起羊、牛、马等动物及人类的炭疽病。炭疽杆菌曾被帝国主义作为致死战剂之一。平时，牧民、农民、皮毛和屠宰工作者易受感染。皮肤炭疽在我国各地还有散在发生，不应放松警惕。