电子发票的记账联可以通过打印纸张来制作，开票人和受票人可以选择任何纸张，包括彩色或黑白纸张，来打印电子发票的版式文件。这些电子发票与税务机关监制的增值税普通发票在法律效力、基本用途和使用规定上完全相同。电子发票可以打印出来，分别作为发票联、记账联等凭证使用，这些打印出的凭证可以作为原始会计凭证。
发票的存根联和记账联各自有不同的用途：
1. 存根联的用途：通常是指已开具的发票用于存档，而发票联则提供给接收方用于账务记录。抵扣联则供接收方用来抵扣进项税额。记账联则是开票方用来进行自身账务记录的。存根联应作为记账凭证的一部分，按照规定，不应该单独保存，而应由专人保管备查。
2. 记账联的用途：它是销售方用于账务凭证的。存根联和记账联由销售方保管。存根联是销售方留存备查用的（增值税专用发票已取消存根联），记账联则是销售方用于账务凭证的。发票的基本联次为三联：第一联为存根联，开票方留存备查；第二联为发票联，接收方作为支付或收款原始凭证；第三联为记账联，开票方作为记账原始凭证。增值税专用发票多出一联“抵扣联”，作为一般纳税人抵扣进项税额的凭证。
根据《中华人民共和国发票管理办法》，开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿应当保存五年。保存期满后，报经税务机关查验后销毁。擅自销毁发票存根联以及发票登记簿的单位和个人，由税务机关责令限期改正，没收非法所得，可以处1万元以下的罚款。原始凭证的保管期限为15年，可以由会计部门保管一年，一年后编制移交清册给本公司的档案管理部门。保管期限到期后，应由该部门进行销毁。
对于电子发票，财务处理方法如下：当销货单位在税务系统中开票后，不需要打印出纸质发票，购货单位可以直接在联网的税务系统中导出并打印。这样，财务室取得的合法开具的电子发票可以作为有效的会计凭证进行账务处理。通常情况下，使用普通打印纸张进行打印就足够了，没有特殊要求。需要注意的是，通过发票模板（从税务局购买的空白发票）在税务系统上打印的，并不属于真正意义上的电子发票。
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